Como se reduce un genoma bacteriano cuando está en una relación íntima con su hospedero
En el artículo de mis amigos Alejandro Manzano y Amparo Latorre se presenta un análisis genómico del proceso de erosión genómica al que se ven sometidas las bacterias que se vuelven simbiontes obligados, de tal manera que se pierden las funciones redundantes y no esenciales de los genes codificados en sus genomas. Es un buen ejemplo de cómo estudiar la evolución del tamaño de los genomas en bacterias, además de un buen trabajo de genómica comparativa, está interesante el ejemplo de la reducción del tamaño de genes en Serratia symbiotica. También vale la pena revisar cómo se realizó el trabajo a nivel metodológico, me gustó mucho la parte de partir el análisis por grupos de funciones.
- Manzano-Marín, A. et al. Snapshots of a shrinking partner: Genome reduction in Serratia symbiotica. Sci. Rep. 6, 32590 (2016).
http://www.nature.com/articles/srep32590/figures/5 Circular plots displaying the different genes involved in functional categories (top left, ribosome; top right, tRNA aminoacylation; middle left, rRNA modifications; middle right, tRNA modification; bottom left, DNA replication and repair; bottom right, transcription and translation) in the informational machinery of S. symbiotica strains and Db11. Outer lines in each circular plot delimit the subcategory. Form outer to inner, the rings in the plot stand for the gene name, the colour-coded lines delimiting categories/complexes, and boxes standing for the presence or absence of the genes in Db11, SAf, SAp, SCt, SCc and STs.
