Viroma y microbioma de pacientes sanos y con infección urinaria
En este estudio comparan el viroma y el microbioma de 10 personas con infección urinaria y 10 sanas. Para esto purificaron la fracción de virus en 1ml de orina y posteriormente los secuenciaron en un chips de 314 puestos en Ion Torrent. Se filtran las secuencias de bacterias y humanas de las de viruses. Para el microbioma se sequenció la region V3 del 16S DNA por Ion Torrent. Para ambos biomas se realizaron analisis de beta y alfa diversidad. Encontraron que el 95% de los pacientes presentaba lecturas de HPV, pero ninguno de alto riego. Para confirmar la presencia de ciertos HPV diseñaron primers y amplificaron por PCR cuantitativo.
Se identificaron que algunos eran homologos a virus relativamente noveles asociados previamente con cancer de piel y otros a lesiones anales. Finalmente, no se encontró asociación a nivel de comunidad tanto del microbioma como del viroma entre los grupos infectados y no infectados.
Santiago-Rodriguez, Tasha M., et al. «The human urine virome in association with urinary tract infections.» Frontiers in microbiology 6 (2015): 14.
Front. Microbiol., 23 January 2015 | http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2015.00014
