El microbioma de un pasto invasor
En este trabajo los autores analizan el microbioma de rizósfera y endósferas de raíz y hoja de Senecio vulgaris, un pasto considerado como una especie invasora en China. La distribución y el muestreo de las plantas fue desde los 1200 hasta los 1800 m.s.n.m. y en una distancia máxima de 100 km entre los sitios. Al analizar la diversidad de bacterias presentes en estos compartimentos se encuentran con que en la rizósfera es significativamente mayor a comparación de la endosfera de raíz y hoja, lo cual habla sobre la probable especialización en un nicho más determinado como ha sido propuesto por autores como Bulgarelli en 2014. De igual manera observan que hay una mayor variabilidad en el microbioma de endósfera de hoja de un mismo genotipo de planta creciendo en distintas locaciones geográficas y que puede ser debido a factores abióticos, mientras que el microbioma de endósfera de raíz es mucho más similar entre todas las plantas. A partir de las secuencias del gen rRNA 16S también llevan a cabo una predicción de posibles funciones codificadas por los OTUs encontrados en los distintos compartimentos y hayan diferencias en las funciones metabólicas predichas entre cada compartimento, mostrando que hay una diferenciación a nivel metabólico entre las comunidades bacterianas presentes en cada microhábitat.
Referencia: (2018) Diversity analysis and function prediction of rhizo- and endophytic bacterial communities of Senecio vulgaris L. (Asteraceae) in an invasive range. PeerJ Preprints 6:e26701v1
