Genes de resistencia a antibióticos presentes en el polvo de ambientes interiores.
En el presente estudio llevado a cabo por Maamar y colaboradores en el 2020, analizaron los metagenomas de 168 muestras de polvo de ambientes interiores. Esto debido a que los humanos pasamos alrededor del 90% de nuestra vida en ambientes interiores, por lo tanto, resulta indispensable identificar qué tipo de resistencias a antibióticos se promueven en estos ambientes dado la problemática actual de salud de bacterias incluso multirresistentes.
Las lecturas procesadas de los 168 metagenomas, los compararon con la base de datos de CARD, y los 183 distintos genes identificados, pertenecen a 15 distintas clases de antibióticos, incluyendo aminoglucósidos, tetraciclinas, macrólidos, penicilinas, cefalosporinas y multiresistencia. Sin embargo, algo que ha sido poco estudiado en los ambientes urbanizados interiores, es saber cómo se movilizan estos genes, y si bien ya se sabe que la mayoría es por transferencia horizontal, por lo tanto, estudiaron lo que de manera general se llama el mobiloma, y sus resultados incluyeron la identificación de elementos móviles genéticos, integrones, elementos transponibles y plásmidos.
No obstante, quisieron comprobar parte de sus resultados con evidencia experimental, por ello, escogieron cultivar uno de sus metagenomas que de acuerdo a sus datos, tenía una mayor abundancia relativa de Staphylococcus, entonces lograron aislar 19 UFCs y una de ellas la eligieron con base también en su morfología, para secuenciar su genoma completo. La UFC fue identificada como Staphylococcus equorum, y a partir de ella hicieron la reconstrucción parcial de 4 de sus plásmidos. Y sólo en uno de ellos (el más pequeño), identificaron elementos transponibles asociados a genes de resistencia. En esta cepa, además en su genoma, identificaron 95 genes de resistencia a antibióticos. Y por ello, decidieron hacer ensayos de resistencia con más antibióticos para esta UFC. No obstante, no se observó en el fenotipo la resistencia, es decir, que los datos encontrados en el metagenoma, no necesariamente coincidieron con los observados en el laboratorio.
Destacan que si bien se necesitan estudios a una escala mucho mayor entre la evidencia computacional y experimental, su estudio es uno de los primeros que trata de explicar cómo se lleva a cabo la movilización de estos genes en ambientes interiores. Pero que sin duda, estos mismos ambientes podrían estar actuando como reservorios, de ahí la importancia de continuar con este tipo de investigaciones.
Ben Maamar, S., Glawe, A. J., Brown, T. K., Hellgeth, N., Hu, J., Wang, J. P., … & Hartmann, E. M. (2020). Mobilizable antibiotic resistance genes are present in dust microbial communities. PLoS pathogens, 16(1), e1008211.
