El poder selectivo del microbioma en plantas es anulado en suelos oligotróficos
Las plantas creciendo en ambientes desérticos cuentan con adaptaciones (xerofíticas) y propiedades que les permite persistir en condiciones adversas. Una de estas propiedades es la formación de una rizo envoltura, la cual se compone principalmente de arena y distintos polisacáridos, la cual ayuda a contender el estrés por desecación y se puede ver como una rizosfera físicamente extendida.
En este trabajo, los autores analizan la diversidad y el filtrado de microorganismos edáficos dentro del microbioma de la riza envoltura, rizosfera y compartimento endofítico de tres especies de pastos (S. sabulicola S. seelyae y C. spinosa) creciendo en una duna desértica en Namibia, con el objetivo de comprender los procesos de filtrado ecológico y ensamblado de las comunidades microbianas de estos nichos.
La estructura de la comunidad bacteriana de la arena circundante y los compartimentos de raíz mostró diferencias composicionales, lográndose distinguir la arena de la rizosfera y rizo envoltura y en tercer lugar, a los compartimentos endofíticos. Por otro lado, encuentran que las comunidades microbianas de la rizosfera, rizo envoltura y endosfera tienen un mayor número de copias del gen 16S rRNA, demostrando a estos micronichos como sitios de alta actividad y diversidad bacteriana. Adicionalmente, la rizo envoltura se encuentra dominada por Actinobacteria y Alphaproteobacteria, mientra que los Firmicutes son predominantes en la endosfera de todas las plantas.
De manera global ven que solo el 2% de los microorganismos identificados como variantes de secuencias (SVs) son ubicuos y las diferencias de la estructura dependiendo de la especie de planta decaen con la distancia espacial entre las plantas. Al analizar redes de coocurrencia de los SVs observan que todas las plantas tienen mayor conectividad e identifican nodos con alta conectividad que corresponden a diferentes SVs asignados como Actinobacteria, particularmente a Microvirga en todas las especies de plantas.
El género Microvirga resulta relevante debido a que puede llevar a cabo diferentes procesos bioquímicos como la formación de biofilm, producción de sideróforos, mineralización de nutrientes y fijación de nitrógeno, permitiendo que interactúe con distintos otros miembros de la comunidad microbiana y explicando su rol como piedra angular en las redes.
Finalmente, se concluye que el poder de selección del microbioma de la planta es anulado por los factores edáficos en ambientes adversos.
Referencia: Marasco, R., Mosqueira, M. J., Fusi, M., Ramond, J. B., Merlino, G., Booth, J. M., … & Daffonchio, D. (2018). Rhizosheath microbial community assembly of sympatric desert speargrasses is independent of the plant host. Microbiome, 6(1), 215.
