Autor: Hugo Barajas

El microbioma núcleo y su potencial para el manejo de agroecosistemas

Los agroecosistemas son ambientes difíciles de manejar debido a las redes complejas de interacción entre macro y microorganismos que los caracterizan. El uso y optimización de las potenciales funciones que los microorganismos brindan al suelo son áreas de investigación cada vez más demandantes para el mejoramiento de la producción agrícola. La descripción de las interacciones…
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Incendios como dispersores de microorganismos en la atmósfera

Las principales fuentes de partículas terrestres que se convierten en aerosoles son polen, hongos, algas, bacterias, arqueas y  detrito biológico. Estas partículas pueden afectar condiciones meteorológicas, ya que conforman partículas de nucleación de hielo en la atmósfera. Los incendios forestales son una fuente importante de aerosoles a la atmósfera ya que, a través de las…
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Bases de datos para ecosistemas específicos basadas en secuencias completas del gen rRNA 16S

La caracterización de comunidades microbianas a través de la secuenciación masiva de bibliotecas de amplicones del gen ribosomal 16S tiene como limitante a las bases de datos contra las cuales se realiza la anotación. Estas bases de datos sub representan a organismos ambientales y no cultivables, y en ocasiones carecen de rangos taxonómicos completos para…
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El metapangenoma. Una enfoque útil para resolver preguntas en ecología microbiana

El pangenoma es un concepto que se refiere al conjunto total de genes dentro de una especie o género bacterianos. Este se divide en genes compartidos por todos los miembros de la especie (núcleo) y en genes exclusivos de algunos miembros (accesorios). Este tipo de información se ha generado a partir de bacterias aisladas con…
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La composición del microbioma del pene puede predecir la indicencia de vaginosis bacteriana

La vaginosis bacteriana (BV) afecta hasta el 50% de las mujeres en África. Esta condición incrementa el riesgo de abortos e infecciones con VIH sin tener un tratamiento efectivo, convirtiéndose en un padecimiento recurrente. Se conoce que el pene es un reservorio de microorganismos que pueden ser aportados al microbioma vaginal, existiendo diferencias entre sujetos…
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Ayuda microbiana para las plantas invasivas

Mikania micrantha es una especie de planta invasora que ocasiona daños a los ecosistemas y pérdidas económicas y se reporta como una de las 100 más dañinas. Su éxito se basa en su rápida reproducción y capacidades regenerativas, además de fuertes efectos alelopáticos y recambio de NPK. Por otro lado, existen hipótesis sobre cómo el…
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Protistas. Aliados menospreciados en el microbioma de las plantas

El microbioma rizosférico está involucrado en la supresión de patógenos, entre otras funciones. La mayor parte de los estudios de este tipo de comunidades microbianas se centran en el análisis de bacterias y hongos que puedan conferir resistencia ante microorganismos que causen enfermedad en las plantas. Sin embargo, otros microorganismos, como los protistas, tienen la…
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Maduración del microbioma supresor de patógenos durante el desarrollo de plantas

El microbioma de las plantas se encuentra relacionado a su estado de salud mediante efectos directos o indirectos. La supresión de patógenos es uno de los mecanismos por los cuales se mejora el estado de salud de las plantas.  La mayoría de los estudios de microbiomas buscando a microorganismos supresores se han centrado en el…
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El metagenoma núcleo de Citrus a través del mundo

El cultivo de cítricos se lleva a cabo desde hace aproximadamente 4000 años. El género Citrus se cultiva en 140 países diferentes, implicando un amplio rango biogeográfico, produciendo hasta 122 millones de toneladas anuales. Debido a esto, el International Citrus Microbiome Consortium (2015) ha realizado el esfuerzo de muestrear suelos y rizosferas de 12 variedades…
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Plantas invasoras y su efecto en la diversidad microbiana del suelo

Las especies invasoras de plantas representan un riesgo a la biodiversidad de los ambientes a los cuales llegan debido a que pueden generar cambios en las dinámicas de nutrientes de los suelos así como desequilibrios en las poblaciones de plantas nativas, las cuales generalmente se ven desplazadas y minimizadas. La mayor parte de los meta…
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El poder selectivo del microbioma en plantas es anulado en suelos oligotróficos

Las plantas creciendo en ambientes desérticos cuentan con adaptaciones (xerofíticas) y propiedades que les permite persistir en condiciones adversas. Una de estas propiedades es la formación de una rizo envoltura, la cual se compone principalmente de arena y distintos polisacáridos, la cual ayuda a contender el estrés por desecación y se puede ver como una…
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El microbioma rizosférico de jitomate es consistente en distintos cultivares y suelos

Los autores de este trabajo analizan la diversidad taxonómica del microbioma de rizosfera de 11 variedades de tomate dentro de un mismo suelo y la comparan contra el microbioma de una de las variedades creciendo en 7 diferentes tipos de suelo, entre ellos, dos sustratos comerciales, con el objetivo de encontrar las similitudes y los…
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La evolución del pangenoma está ligada a la especificidad del hábitat

Los microorganismos se encuentran colonizando toda la biósfera, incluyendo seres vivos y objetos inanimados. Por esta razón, los nichos que colonizan son diversos y cuentan con distintas propiedades, que finalmente pueden repercutir en la diversidad, evolución y mantenimiento de un estilo de vida definidos en los microorganismos. Una de las maneras de evaluar la diversidad…
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Respuestas metabólicas de comunidades microbianas en condiciones de sequía prolongada

La limitación de agua en los suelos ocasiona que la tasa de descomposición de la materia orgánica disminuye debido a que la actividad metabólica de los microorganismos se ve reprimida por el estrés hídrico. Diferentes trabajos han logrado identificar y aislar  a microorganismos resistentes al estrés hídrico, los cuales se han seleccionado y adaptado en…
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La supresión de patógenos depende de la composición del microbioma inicial del suelo

Las interacciones entre plantas y patógenos pueden ser moduladas mediante la inducción del sistema inmune innato de la plantas o vía la supresión de los patógenos por miembros de la comunidad microbiana del suelo. La supresión de los patógenos es una característica que ha sido observada en algunos suelos manejados bajo monocultivo y dicha característica…
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