Categoría: blog

Análisis de una comunidad sintética de raíces de maíz que inhibe el crecimiento de patógenos.

Las asociaciones planta microbiomas son importantes para el crecimiento y salud del hospedero. Sin embargo, poco se sabe sobre cómo se ensambla una comunidad y los efectos benéficos de los microbiomas sobre las plantas.  Estudios previos en plantas y humanos, han demostrado que se pueden ensamblar comunidades sintéticas disminuidas (es decir que estén constituidas por…
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Global Catalogue of Microorganisms

En el 2013, menos de una sexta parte de las colecciones cultivables de microorganismos estaban registradas en la base de datos Culture Collection INFOrmation (CCINFO), restringiendo así la accesibilidad a estas. Con el fin de establecer un catálogo electrónico con las colecciones cultivables la World Data Centre for Microorganisms (WDCM) construyó un sistema para manejo…
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Resiliencia del microbioma de suelo en respuesta a contaminación por metales y crecimiento de plantas.

Los ecosistemas agrícolas continuamente están bajo perturbaciones ambientales como sería la contaminación con metales. En los ecosistemas terrestres, los microorganismos asociados a suelo desempeñan un papel importante manteniendo los ciclos biogeoquímicos. Por lo que la determinación de la dinámica de estas comunidades y sus funciones en los agroecosistemas en respuesta a la contaminación podría proporcionar…
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Evolución metabólica y la autoorganización de ecosistemas

Los ecotipos de Prochlorococcus tienen una estructura particular en los océanos: los ecotipos de divergencia reciente adaptados a mucha luz (HL) son abundantes en la superficie, mientras que aquellos más antiguos y adaptados a poca luz (LL)  son más abundantes a mayor profundidad. En este trabajo los autores buscan determinar qué fuerzas de selección provocaron…
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Entendiendo la dinámica de la comunidad para incrementar la optimización de la selección artificial de microbiomas.

La selección artificial de comunidades microbianas es una técnica poderosa y atractiva que se ha utilizado en muy pocos estudios. Posiblemente, esto se debe a la falta de éxito por una mala optimización del proceso. Por una parte, se sabe que las comunidades microbianas naturales son muy dinámicas y, por lo tanto, pasan por etapas…
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Resistencia a herbivoría en interacciones planta-microorganismo

Durante los procesos de sucesión, el acondicionamiento del suelo por las diferentes comunidades de plantas puede contribuir a cambios en la interacción planta-herbívoro, además de modificar la calidad nutricional y las defensas de la planta. Sin embargo, debido a los tiempos de generación tan cortos, los microorganismos del suelo tienen el potencial de adaptarse mucho…
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Cambios en las comunidades virales relacionados con el nivel de profundidad de drenajes de minas de azufre en China

Los virus se encuentran de forma abundante en las comunidades microbianas ambientales, influyen en la ecología, evolución y fisiología del huésped al causar su mortalidad, facilitar la transferencia horizontal de genes e influir en los ciclos biogeo-químicos a través de la producción de materia orgánica que se disuelve durante la lisis celular o bien, participan…
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Integración de redes para identificar respuestas metabólicas clave de microbiomas de suelos perturbados

El método MEMPIS permite identificar genes y reacciones metabólicas específicas a ciertas condiciones mediante la incorporación de perfiles metabólicos y de expresión de genes. Sin embargo, no permite establecer las conexiones entre los genes específicos de ciertas  condiciones (GEC) y otros genes, así como el papel que juegan en la respuesta del microbioma que se…
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Efectos de la contaminación por Zinc sobre microbioma de raíz del álamo N12, tolerante a metales

La contaminación por metales pesados (MP) cada vez aumenta más debido a las actividades humanas. Los MP, no se degradan por lo que tienden a persistir en el ambiente por largo tiempo. EL Zinc (Zn) es un MP que puede resultar fitotóxico si se encuentra en grandes cantidades en el suelo. Aunque existen plantas que…
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Efecto de la planta y su microbioma de rizósfera para reducir la herbivoría por insectos

El genotipo de la planta es capaz de regular la resistencia a insectos herbívoros alterando la acumulación de metabolitos primarios y secundarios. Por ejemplo, los glucosinolatos (GLS) son metabolitos secundarios que impiden que los insectos continúen alimentándose de las hojas de la planta. A pesar de que se conoce el efecto del genotipo de la…
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PICRUSt2, una herramienta para la predicción de las funciones en metagenomas.

Una de las estrategias más usadas para la caracterización de las comunidades, es secuenciar genes que están altamente conservados como el 16S rRNA. El cual es un marcador taxonómico y se utiliza mucho para determinar la abundancia relativa de los grupos de bacterias presentes en una comunidad. Sin embargo, las funciones metabólicas de las comunidades…
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Suelos transparentes para fenotipificación de raíces

El cultivo de plantas para investigación se realiza utilizando medios sólidos que emulen el suelo pero que son demasiado opacos para fines de investigación, además de que ofrecen un control limitado de las características que afectan al desarrollo de raíces. Como alternativa se ha usado hidroponía y aeroponía pero no representan las condiciones de cultivo…
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Bacterias en las nubes.

Los microorganismos que pueden vivir en el aire, especialmente bacterias, provienen de diferentes fuentes ambientales: suelo, plantas, agua…y hay estudios que indican que pueden permanecer aerolizados hasta por 3 días antes de que se depositen en alguna superficie, no obstante, sólo una pequeña fracción de ellos permanecen en estado viable. Por otra parte, las comunidades microbianas…
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Endófitos asociados a raíces y hojas de plantas que crecen en ambientes extremos en Chile.

Funciones benéficas para las plantas han sido atribuidas a algunas bacterias endófitas. Muchas de ellas llevan a cabo funciones como la promoción del crecimiento vegetal. Esta promoción, puede ocurrir a través de mecanismos que les permiten: fijar nitrógeno, proteger contra patógenos, detoxificar una gran cantidad de compuestos tóxicos y producir metabolitos secundarios como lo son…
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Conservación del microbioma núcleo de raíz de distintos phyla de plantas

En este trabajo se evaúa el impacto que tienen plantas filogenéticamente distantes creciendo en proximidad a lo largo de una cronosecuencia de suelo (Great Sandy National Park en Cooloola, Australia). Entre los sitios a lo largo de la cronosecuencia hay un empalme de las especies de plantas, de manera que es posible evaluar la influencia…
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