Coocurrencia de subcomunidades microbianas con capacidades metabólicas complementarias

En éste trabajo, se analizaron las bases de datos disponibles de secuencias del gen 16S rRNA de diversas muestras: suelo, agua e intestino humano. Con ésta información, se identificaron las comunidades presentes en cada muestra, así como subcomunidades coocurrentes que se encuentran representadas en la mayoría de las muestras. Tras identificar las especies de cada comunidad, se obtuvieron los genomas de cada una de ellas para estudiar su potencial metabólico, con ello se estimaron métricas de competencia y cooperación entre las comunidades. Los resultados sugieren interdependencia en las subcomunidades microbianas, las cuales presentan capacidades biosintéticas complementarias que favorecen la supervivencia del grupo.

Fig. 1. Higher-order species co-occurrence in microbial communities. (A) We consider community composition at two different levels. Sample communities are composed of all species identified by 16S ribosomal RNA in sampling sites. Co-occurring subcommunities are species groups found together more often than expected by chance (Methods), and are thus likely to be functionally dependent. (B) Inter- and intraphyla interactions in co-occurring subcommunities including 381 pairs, 3,322 triplets, and 3,518 quadruplets. (C) Species overlap and distribution of phyla among the co-occurring subcommunities of different size.

Zelezniak A., Andrejev S., Ponomarova O., Mende D. R., Bork P., Patil K. R. (2015). Metabolic dependencies drive species co-occurrence in diverse microbial communities. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 112, 6449–6454. 10.1073/pnas.1421834112.