Dr. Luis David Alcaraz
Profesor investigador
Departamento de Biología Celular
Facultad de Ciencias
Universidad Nacional Autónoma de México
Estudie biología en la Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional Autónoma de México. Obtuve el doctorado en biotecnología por el Cinvestav-Irapuato. Realicé una primera estancia postdoctoral en el Centro Superior de Investigación en Salud Pública en Valencia, España. Posteriormente, una breve segunda estancia postdoctoral en la Wilfrid Laurier University de Canadá y volví a México y de 2012 a 2017 fui investigador del Instituto de Ecología de la UNAM. A partir del 2017 me incorpore como profesor-investigador al Departamento de Biología Celular en la Facultad de Ciencias de la UNAM. Me he especializado en estudiar genomas y metagenomas de bacterias, ya sean de vida libre, ambientes contaminados y en asociación con otras especies como el caso de microbiomas de plantas y humanos. También disfruto analizando genomas de plantas, hongos y otras especies utilizando herramientas bioinformáticas.
Soy profesor del curso de Biotecnología 1 en la Facultad de Ciencias, UNAM
En posgrado doy un curso anual de Introducción a la Bioinformática, participo en múltiples cursos de genómica y en la sección de interacción planta-microorganismo (microbiomas) del curso de Fisiología de Plantas.
Soy tutor acreditado de los siguientes posgrados de la UNAM:
Ciencias Bioquímicas
Ciencias Biológicas
Distinciones:
2020 – Reconocimiento Distinción Universidad Nacional para Jóvenes Académicos
2017 – Miembro del Sistema Nacional de Investigadores, Nivel 2
2011 – 2017 Miembro del Sistema Nacional de Investigadores, Nivel 1
Publicaciones actualizadas:
Google Scholar: http://scholar.google.com.mx/citations?user=xHDo8RUAAAAJ
Research Gate: https://www.researchgate.net/profile/Luis_Alcaraz2
Mendeley: http://www.mendeley.com/profiles/luis-david-alcaraz
Redes sociales:
Twitter: @ldalcaraz
Experiencia previa:
2012-2017 Investigador Asociado C de T.C. Instituto de Ecología, Universidad Nacional Autónoma de México
2012 – 2012 Estancia postdoctoral, grupo del Dr. Gabriel Moreno-Hagelsieb. Wilfrid Laurier University. Biology Department. Waterloo, Ontario, Canadá.
2010 – 2012 Investigador postdoctoral asociado al grupo del Dr. Alex Mira. Centro Superior de Investigación en Salud Pública (CSISP). Departamento de genómica y salud. Valencia, Comunidad Valenciana, España.
2004 – 2009 Doctorado en Ciencias. Biotecnología. Centro de Investigación y de Estudios Avanzados (Cinvestav-Irapuato). Departamento de Ingeniería Genética. Bajo la dirección de la Dra. Gabriela Olmedo Álvarez. Tesis Doctoral: Aproximación genómica a la evolución y ecología de Cuatro Ciénegas, Coahuila, México y del género Bacillus. Cinvestav-Irapuato, Guanajuato.
1998 – 2004 Licenciatura. Biología. Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México. Bajo la dirección del Dr. Víctor Valdés López. México D.F. Tesis de Licenciatura: Retropseudogenes de las chaperoninas mitocondriales en el genoma de Mus musculus como modelo para estudiar la expresión genética en el pasado. Facultad de Ciencias, UNAM.
Alumnos titulados Maestría
Gerardo Mejía Vázquez (17 de septiembre de 2019). Trampas biológicas para reclutar microbiomas asociados a plantas, en múltiples tipos de suelos (2017-2). Tesis de Maestría. Ciencias Bioquímicas, Universidad Nacional Autónoma de México.
Arely Lechuga (7 de octubre de 2019). Búsqueda de comunidades bacterianas promotoras del crecimiento en plantas. Tesis de Maestría. Ciencias Bioquímicas, Universidad Nacional Autónoma de México.
Cristóbal Alejandro Hernández Álvarez (28 de junio de 2018). Microbiomas de Cucurbita: Estructuración en condiciones contrastantes de aridez histórica en campo y en un experimento controlado. Tesis de Maestría. Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Autónoma de México.
Miguel Fernando Romero Gutiérrez (15 de noviembre 2017). Metagenómica comparativa de la rizósfera de Acacia farnesiana establecida en jal minero. Tesis de Maestría. Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Autónoma de México.
Daniela Shamayim Martínez Sánchez (13 de diciembre 2017). El título de su proyecto es: “Análisis del microbioma de rizósfera visto a través de diferentes suelos y hospederos”. Tesis de Maestría. Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Autónoma de México.
Jazmín Itzel Blaz Sánchez (13 de diciembre 2017). El título de su proyecto es: “Caracterización del rizobioma de especies con potencial fitoestabilizador”. Tesis de Maestría. Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Autónoma de México.
Diana Patricia Gallego Briseño (14 de diciembre 2017). El título de su proyecto es: “Microorganismos con potencial de biorremediación de jales mineros”. Tesis de Maestría. Ciencias Biológicas, Universidad Nacional Autónoma de México.
Barajas de la Torre Hugo Rafael. (27 de mayo 2016). Metagenómica de rizosferas en distintos tipos de suelos de México. Tesis de Maestría. Posgrado en Ciencias Bioquímicas, Universidad Nacional Autónoma de México.
Alumnos titulados Licenciatura
Pedro Rodríguez Martín (14 de junio 2019, Biología, FES Iztacala, UNAM). “Caracterización del microbioma bacteriano y fúngico de un biofertilizante utilizado como promotor de crecimiento vegetal”
Carolina Rocha Arriaga. (26 de enero 2018, Ciencias Agrogenómicas ENES-León-UNAM). “Denominación de origen y estudio metagenómico del Pulque del Estado de Hidalgo, México” Codirección con el Dr. Luis Alfredo Cruz Ramírez (Langebio).
Oscar Francisco González Gutiérrez (28 de julio 2016, Biología, FC, UNAM). “Distribución filogenética de las proteínas de la biosíntesis de carotenoides en bacterias”.
Selene Molina Cruz (23 de noviembre 2015, QFB, FQ-UNAM). Comparación funcional entre agua y sedimentos mediante metagenómica, pistas funcionales para la sostenibilidad de Cuatro Ciénegas.
Daniela Shamayim Martínez Sánchez (7 de mayo 2015, Biología, FC, UNAM). Diversidad taxonómica del microbioma de la planta carnívora Utricularia gibba.
Hugo Barajas de la Torre (13 de junio 2014 QFB, FQ-UNAM). Análisis del genoma núcleo y pangenoma del género Streptococcus.
Julio Alfonso Cruz Medina (17 de junio 2009, Biología, FCN, UAQ), Análisis bioinformático de uso de anticodones y distribución de finales de secuencias CCA en el extremo 3’ de los tRNAs Bacterianos. Codirección con el Dr. Juan Campos-Guillén.
Tesis en proceso Doctorado
Hugo Barajas de la Torre (Ciencias Bioquímicas, UNAM). El título de su trabajo es: “Metagenómica de rizósferas en distintos tipos de suelo de México”. Inicio en 2017-1, finaliza en 2020.
Miguel Fernando Romero Gutiérrez (Ciencias Biológicas, UNAM). El título de su trabajo es: “Evaluación y desarrollo de estrategias de análisis comparativos del potencial metabólico predicho a partir de datos metagenómicos”. Inicio en 2018-2.
Cristóbal Alejandro Hernández Álvarez (Ciencias Biológicas, UNAM). El título de su trabajo es : ”Diversidad taxonómica y metagenómica de bacterias asociadas a plantas en condiciones de aridez”. Inicio en 2019-1.
Angélica Mariana Jara Servín (Ciencias Bioquímicas, UNAM). El título de su trabajo es: “Efectos fenotípicos y metagenómicos asociados al trasplante de microbiomas rizosféricos”. Inicia en 2020-1
Tesis en proceso Maestría
Carolina Gonzalez Cedillo (Maestría, Ciencias Bioquímicas, UNAM). Metagenómica del metro de la ciudad de México: Estudio, identificación y análisis del metabolismo de los microorganismos y su relación con mecanismos de patogenicidad y resistencia (2018-2). (Co-tutoría con la Dra. Mariana Peimbert Torres; UAM-Cuajimalpa).
Leslie Nuñez López (Maestría, Ciencias Bioquímicas, UNAM). Genómica comparativa de la adquisición de hierro por sideróforos en bacterias
Tesis en proceso Licenciatura
Luis Gerardo Romero Chora (Licenciatura, Biología, FC-UNAM). Búsqueda de genes de asimilación y metabolismo de fosfonatos en genomas bacterianos y metagenomas.