Caulobacter, un género poco explorado en ambientes terrestres

El género Caulobacter ha sido históricamente aislado de ambientes acuáticos y por ende descrito como un microorganismo con un estilo de vida oligotrófico. En este trabajo, Willhelm realiza un meta análisis de estudios donde se caracterizan microbiomas por medio de bibliotecas de amplicones del gen rRNA 16S y también metagenomas completos. El objetivo del estudio es encontrar diferencias genómicas entre aislados o genomas reconstruidos de distintos ambientes como océanos, lagos, sedimentos, suelos y rizósferas; las cuales puedan explicar diferencias en el estilo de vida y distintas estrategias que permitan la adaptación de estas bacterias a la vida terrestre o acuática. El autor muestra que la prevalencia y diversidad de Caulobacter en ambientes terrestres es significativamente mayor que en cuerpos de agua, éstos genomas tienen un mayor tamaño y cuentan con una mayor cantidad de genes relacionados a la adhesión (hfaAB) y metabolismo de compuestos complejos de carbono (glicósido hidrolasas/dioxigenasas) los cuales les confieren una mayor diversidad de estrategias para la obtención de nutrientes. Finalmente, se levanta el cuestionamiento sobre la importancia ecológica de este grupo bacteriano en los procesos de degradación y ciclaje de carbono poco considerado en sistemas terrestres.

Referencia:

Wilhelm, R. C. (2018). Following the terrestrial tracks of Caulobacter-redefining the ecology of a reputed aquatic oligotroph. The ISME journal.