Uso de técnicas de expresión génica mediada por inductores como herramienta para identificación de genes de interés provenientes de suelos contaminados.

Este trabajo presenta una técnica detallada para la captura de genes relacionados a la degradación de hidrocarburos aromáticos y poliaromáticos a partir de DNA metagenómico de suelos contaminados estos compuestos. La identificación de dichos genes se basa en la inducción por substrato (hidrocarburos aromáticos) en bibliotecas de clonas, las cuales son separadas por citometría de flujo aprovechando la fusión del inserto a un gen reportero. Finalmente se logran obtener y secuenciar los genes de interés. Sumado a esto se utiliza la información de contigs metagenómicos para mapear los genes e intentar ampliar su contexto genómico.

Meier, M. J., Paterson, E. S., & Lambert, I. B. (2016). Use of Substrate-Induced Gene Expression in Metagenomic Analysis of an Aromatic Hydrocarbon-Contaminated Soil, 82(3), 897–909. http://doi.org/10.1128/AEM.03306-15