Estudio de bacterias magnetotácticas no cultivables mediante Single Cell Genomics
Las bacterias magnetotácticas que pertenecen a phyla basales han sido tratado de aislar sin éxito, se han analizado metagenomas de estas comunidades, sin embargo la información que brindan estos análisis se limitan a los miembros más abundantes de dichas comunidades. Mediante una aproximación de Single Cell Genomics fue posible obtener tres drafts de genomas de bacterias magnetotácticas no cultivables, que pertenecen a phyla basales, obteniendo una excelente resolución de los genomas, Candidatus Magnetobacterium bavaricum y CandidatusMagnetoovum chiemensis CS-04 del Phylum Nitrospirae y Candidatus Omnitrophus magneticus SKK-01 del Phylum Omnitrophica. Realizar un análisis funcional y comparativo de los drafts, los cuales revelaron un estilo de vida quimiolitoautótrofo y observaron que los genes involucrados en la biosíntesis de magnetosomas están altamente conservados.
Bibliografía citada: Kolinko S., Richter M., Glöckner F.O., Brachmann A. & Dirk Schüle D. (2016) Single-cell genomics of uncultivated deep-branchingmagnetotactic bacteria reveals a conserved set of magnetosome genes Environmental Microbiology 18(1), 21–37