Factores que determinan la microbiota rizosférica del roble blanco
Con la finalidad de profundizar en el estudio de las variables ambientales que modean la microbiota de raíz, se estudió la microbiota de la rizósfera del roble blanco (Tabebuia heterophylla) para probar su respuesta ante el clima y la geología del suelo. Para cumplir con su objetivo, los autores del trabajo tomaron muestras de suelo y raíz de roble blanco en Puerto Rico, tomando en cuenta suelos kársticos, volcánicos y en serpentinas; en sitios cálidos y fríos, húmedos y secos; y de altitud baja y elevada; en los que los árboles muestran distintas morfologías foliares.
De manera general, la riqueza de OTUs de la rizósfera fue mayor que la de los suelos, aunque no se observó dicho patrón en todos los sitios. Los niveles de riqueza más altos se encontraron en los sitios de serpentina sin importar las otras variables. En cuanto a la agrupación de muestras de acuerdo con la diversidad beta, se observó un cierto grado de separación entre las muestras de suelo y las de rizósfera, con agrupación de las muestras de suelos kársticos. Cabe mencionar que estas diferencias e la microbiota de los sitios karsticos corresponden con diferencias morfológicas en los árboles de dichos sitios, que a su vez podrían estar relacionadas con diferencias en la temperatura y la disponibilidad de agua.
Los Phyla más dominantes detectados fueron Proteobacteria, Actinobacteria y Acidobacteria; encontrando en alta abundancia a Crenarchaeota. En relación con las variables ambientales analizadas, los sitios con temperaturas más bajas presentaron mayores proporciones de Verrucomicrobia y Acidobacteria; mientras que los más cálidos Actinobacteria y Chenarchaeota. Los sitios con baja elevación mostraron una mayor cantidad de Actiobacteria, Acidobacteria Y Gemmatimonadetes. Los sitios kársticos, que como se mencionó anteriormente mostraron diferencias al resto, se cacterizan por la presencia de Rhodocyclales, Rubrobacter, Solirubrobacter y Rhizobium.
De este modo, se puede apreciar que factores geológicos y climáticos tienen un efecto sobre la composición de las comunidades microbianas asociada a raíz, mismas que podrían estar ligadas de alguna forma con las diferencias fenotípicas observadas en las distintas poblaciones de roble blanco.
Referencia:
Ortiz, Y., Restrepo, C., Vilanova-Cuevas, B., Santiago-Valentin, E., Tringe, S. G., & Godoy-Vitorino, F. (2020). Geology and climate influence rhizobiome composition of the phenotypically diverse tropical tree Tabebuia heterophylla. PloS one, 15(4), e0231083.
