Desde que se llevó a cabo el Proyecto del Microbioma Humano (HMP, por sus siglas en inglés), se supo que había determinados microorganismos que, por lo general, se hallaban presentes en los humanos. Posteriormente, diversos estudios han demostrado que particularmente, puede haber microorganismos específicos asociados a cada persona, lo que engloba el concepto de “Personal…
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Este trabajo se centra en la posibilidad de la restauración de ecosistemas perturbados por la actividad humana, particularmente tierras de cultivo, utilizando inóculos de suelo. Existen evidencias de la relación entre la comunidad residente en distintos suelos con el tipo de cobertura vegetal presente en ellos. Con base en ese conocimiento, los autores llevan a…
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Desde hace años se ha reportado asociaciones del microbioma intestinal y el cebrero, por ejemplo, su influencia en el estado de ánimo, en el autismo, en el control del apetito, etc. Sin embargo, el fuerte vinculo de la dieta como principal moldeador del microbioma humano ha permanecido como un factor de confusión. En este trabajo…
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El Sistema de Transporte Colectivo Metro de la Ciudad de México es uno de los subterráneos más grandes del mundo y que es utilizado por gran proporción de la población urbana. ¡Se estima que aproximadamente al día 4 millones de personas usan este medio de transporte! Y como sabemos, existen microorganismos que se encuentran asociados…
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Se cree que una baja disponibilidad de agua en la rizósfera puede evitar su colonización y el flujo de nutrientes. Además, los cambios fisiológicos que experimenta la planta pueden cambiar los patrones de exudado de fotosintatos. Estos fenómenos podrían estar modificando la composición del microbioma rizosférico en temporadas de secas y de lluvias. Por lo…
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Hace tiempo que me gustaría tener uno de estos aparatejos. En la carrera de secuenciación masiva de DNA la secuenciación mediante nanoporos ha sido un anhelo, comenzó casi como mito y anunciado con mucha premura, luego lo hicieron disponible a centros de secuenciación establecidos y ahora está a la venta libre. Los nanoporos son una…
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Conocemos que diferentes propiedades edáficas del suelo, como el pH o el contenido y disponibilidad de nutrientes son responsables de los patrones de diversidad taxonómica en sus comunidades bacterianas. Los autores de este trabajo evalúan el impacto de distintos factores edáficos en la diversidad metabólica de las comunidades bacterianas de suelos sobre un gradiente de…
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En este artículo los autores proponen una técnica por extracción total de RNA para detectar y cuantificar miembros de una comunidad microbiana. A diferencia del uso de metagenomas, amplicones de 16S rRNA e ITS esta técnica promete identificar al mismo tiempo y de forma más eficiente bacterias y hongos que se encuentren en las muestras.…
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Con la finalidad de conocer las implicaciones ecológicas y evolutivas del microbioma de las plantas, se estudiaron 30 especies pertenecientes a seis familias del grupo de las angiospermas. La caracterización se realizó por medio del gen 16S del RNA ribosomal a nivel de endósfera y rizósfera. Estos análisis permitieron determinar que la similitud de las…
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En este artículo de Boller y He de 2009 en Science, los autores hacen una revisión de los mecanismos por los cuales las plantas activan sus mecanismos de defensa frente a patógenos microbianos; estos mecanismos de defensa de las plantas se conocen colectivamente como el sistema inmune innato, el cual detecta y neutraliza a microbios…
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En este articulo que les comparto buscan explicar la utilidad de los indices de diversidad y la mejor manera de realizar los análisis entre los grupos que estemos comparando. La idea es lograr identificar el tipo de análisis que requieren tus datos según el diseño de tu estudio (Ej. temporal o transversal). Para elegir la…
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Hola, esta es mi primera entrada en el Journal Club. Y elegí este artículo porque me pareció muy interesante que a estos científicos de Alemania les interesara investigar a los microorganismos presentes en las esponjas que utilizamos en la cocina para lavar nuestros trastes. La justificación es que, en espacios interiores, en este caso las…
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El objetivo principal de este estudio fue revelar patrones en las comunidades microbianas de los suelos. Para esto utilizaron 1998 muestras, provenientes de 30 estudios diferentes, con sus respectivas secuencias del gen 16s RNAr. Utilizando una maquina de aprendizaje que es capaz de contabilizar interacciones complejas entre los taxa, midieron la forma en que taxones…
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A través de éste estudio experimental, se prueba la influencia del estrés hídrico en el establecimiento de comunidades bacterianas de suelo, rizósfera y endósfera. Se utilizaron muestras de 18 especies de pastos (9 de metabolismo C3 y 9 de metabolismo C4), que fueron tratados como controles (sometidos a condiciones de riego normal) o expuestas a…
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