En este trabajo se observa la variación que existe en el microbioma de rizósfrera en plantas con diferentes estrategias de adquisición de hierro (cebada y tomate). Las plantas fueron estresadas por deficiencia de este nutriente en un sistema hidropónico y cultivadas en dos suelos de características distintas, principalmente la cantidad de carbono inorgánico. Las distintas…
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En humanos, la infección por Clostridium difficile presenta diversas complicaciones que pueden causar la muerte. Con la caracterización del microbioma sano (Proyecto de Microbioma Humano), se pueden encontrar patrones bacterianos que definan el desequilibrio en diversas patologías, en este caso, en el intestino. En este artículo, se realizaron transplantes de microbiota de pacientes sanos a…
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Las bacterias magnetotácticas que pertenecen a phyla basales han sido tratado de aislar sin éxito, se han analizado metagenomas de estas comunidades, sin embargo la información que brindan estos análisis se limitan a los miembros más abundantes de dichas comunidades. Mediante una aproximación de Single Cell Genomics fue posible obtener tres drafts de genomas de bacterias…
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Los compuestos volátiles bacterianos pueden actuar de diferentes formas, ya sea elicitando Respuesta Sistémica Inducida en las plantas o actuando directamente contra patógenos, en este trabajo prueban los compuestos producidos por Bacillus subtilis GB03 en Arabidopsis contra el hongo patogeno B. cinerea. En este caso encuentran que el principal papel de estos compuestos es como…
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En este trabajo estudian el establecimiento de bacterias simbióticas en el intestino de una hormiga del desierto de Sonora (Cephalotes rohweri). En el caso de esta hormiga una biopelícula que se forma en el proventrículo de su intestino parece ayudar a mantener un microbioma estable a través de la vida y se discuten las posibilidades…
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Como consecuencia del uso extensivo de antibióticos en el ganado, el estiércol utilizado para fertilizar cultivos podría ser un reservio de bacterias resistentes a antibióticos, capaz de diseminarse a otras fuentes relacionadas con los humanos. En éste trabajo, se utilizó la metagenómica para evaluar la presencia de genes de resistencia a antibióticos presentes en el…
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Alfano y colaboradores analizaron el microbioma (16S rRNA) de dos koalas en cautiverio, en diferentes sitios del cuerpo: intestino, recto, cavidad oral y ojo. Compararon los resultados con el microbioma de koalas de vida libre. Se emplearon el índice de Shannon, distancia filogenética e igualdad (evenness) para calcular la diversidad alfa (diversidad dentro de cada sitio).…
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El mismo Darwin estudió estas plantas y observó que las trampas de Utricularia y sus fluidos una vez que capturaban la presa se tornaban de un color obscuro hasta que el animal quedaba literalmente fuera de la vista. Darwin en su libro Insectivorous plants (1865), describe que tiene la sospecha de que las trampas secretan algún tipo de…
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Pseudomonas putida es una bacteria que puede vivir como endofita en diferentes plantas, en este trabajo realizan inoculaciones de la cepa BP25 en plantas de Arabidopsis thaliana Col-0 y encuentran alteraciones en el fenotipo de las plantas inoculadas, los cuales son dependientes de la densidad bacteriana en el inoculo; además de esto analizan la…
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Estudiantes del grupo 5390, si horario se mantiene viernes 14:30-17:30, pero cambian de profesor de teoría al Dr. Juan Luis Chávez Pacheco Muchas gracias por su comprensión.
Este modelo, propuesto por Borozan, Watt y Ferreti, integra la información que aporta cada una de una serie de medidas de similitud de secuencias; algunas de ellas dependientes de alineamiento y otras independientes de alineamiento. Dado que algunas medidas son más informativas según las secuencias que se están analizando, este modelo pondera cada medida según…
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En este trabajo propusieron cultivar paralelamente dos consorcios microbianos bajo las mismas condiciones que las comunidades naturales, para obtener el metagenoma de ambos y con las diferencias de abundancia de especies entre ambos consorcios reconstruir casi completamente las secuencias de los genomas de las especies. Esto lo proponen como un método para estudiar la…
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La hipótesis de la bioprecipitación, señala que existe un ciclo en el que las plantas liberan ciertas partículas que contienen microorganismos que llegan a formar parte de las nubes. Estos microorganismos favorecen la precipitación y con ello el desarrollo de nuevos microorganismos y el crecimiento de las plantas. En el caso de las γ-proteobacterias, la…
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Este trabajo presenta una técnica detallada para la captura de genes relacionados a la degradación de hidrocarburos aromáticos y poliaromáticos a partir de DNA metagenómico de suelos contaminados estos compuestos. La identificación de dichos genes se basa en la inducción por substrato (hidrocarburos aromáticos) en bibliotecas de clonas, las cuales son separadas por citometría de…
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En la actualidad existen diversos programas para el tratamiento de desechos de una manera sustentable.La biomasa de lignocelulosa consiste en tres polímeros: celulosa, hemicelulosa y lignina. Los procesos químicos que se emplean para la hidrólisis de estos polímeros generalmente contaminan al ambiente. En este artículo, Konanani, et. al., utilizando metagenómica, realizaron un screening de genes…
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