Lectura 8 de mayo

Lectura 8 de mayo

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Pyhäjärvi, T., M. B. Hufford, S. Mezmouk y  J. Ross-Ibarra. 2012. Complex patterns of local adaptation in teosinte. Genome Biology and Evolution doi:10.1093/gbe/evt109

Una respuesta

  1. Andrés Argüelles Moyao dice:

    Las diferencias adaptativas entre poblaciones contemporáneas muy emparentadas, son ejemplos del impacto de la selección natural sobre los polimorfismos genéticos. Una aproximación para ligar a la adaptación con la diversidad genética es la ecología reversa. Esta aproximación usa un número de métodos estadísticos y de genética de poblaciones para identificar a los loci que presuntamente estuvieron bajo selección. En estos loci se espera que presenten un alto grado de diferenciación genética entre las poblaciones y un bajo grado de diferenciación dentro de las poblaciones. Existen varios métodos emparentados para identificar loci que tienen un alto nivel de diferenciación. Estos métodos se basan en identificar los valores extremos de Fst al generar una distribución nula de las Fst de un modelo simple neutral. Para las plantas, la adaptación a condiciones locales es especialmente importante porque al ser organismos sedentarios no pueden migrar a mejores condiciones. Para el caso del teosinte, sus poblaciones presentan una estructura compleja jerárquica. En el trabajo, los autores presentan el examen genético de las adaptaciones locales entre 21 poblaciones de teosintes (var. mexicana y parviglumis). Dde las 21 poblaciones con muestras de entre 10 y 12 individuos, lograron tipificar exitosamente 248 muestras con 36719 SNPs. Además, el nivel de heterocigosis entre las dos subespecies varía muy poco, pero existe una considerable variación entre las poblaciones de ambos taxa. La estructura de la frecuencia alélica en el teosinte varió en múltiples niveles jerárquicos. La distancia geodésica y la altitud aparentemente están correlacionadas con las diferencias en las poblaciones. Aparentemente las inversiones tienen un papel en la adaptación local. Estas inversiones muestran un enriquecimiento de SNPs y tienen un alto factor de Bayes. Por lo que las diferencias en la población y la correlación ambiental sugieren que las inversiones y los polimorfismos intergénicos están involucrados en la adaptación local.

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