Influencia del genotipo y el sustrato en el microbioma de rizósfera de seis especies de planta
Éste trabajo se realizó con la finalidad de conocer la influencia que ejercen las plantas (Arabidopsis, Medicago, Brachypodium, Brassica, Pisum y Tricum) y el suelo en las comunidades microbianas de la rizósfera. Para ello se utilizó un inóculo de suelo original que se mezcló con dos sustratos estériles diferentes: uno de arena (pobre en nutrientes) y otro de composta (rico en nutrientes). Posteriormente se realizó el mismo procedimiento por otras dos generaciones y se estudiaron las comunidades microbianas de cada generación por medio de amplicones y el método ARISA.
Como resultado del experimento, se observó que en la mayoría de los casos, las comunidades bacterianas de las mismas plantas eran más similares entre sí que respecto a las demás, lo que resalta la importancia del genotipo hospedero. Por otro lado, a lo largo de las generaciones, la diversidad microbiona fue más estable en la composta que en la arena, lo que resalta la importancia de los nutrientes en el mantenimiento de la diversidad microbiona a través del tiempo.
Figure 3 The effect on the bacterial rhizosphere microbiota of plants grown in sand compared with compost. Each sphere represents a single OTU, size represents abundance, position corresponds to the relative abundance in the three rhizospheres and colour reflects the rhizosphere abundance relative to unplanted soil calculated for each generation separately. Please refer to Supplementary Figure S6 for an example explanation. (a) Bacterial microbiota of model plants grown in sand. (b) Bacterial microbiota of model plants grown in compost. (c) Bacterial microbiota of crop plants grown in compost. Only OTUs with a relative abundance of greater than 0.1% were used. Achromobacter xylosoxidans (Ax), Acidovorax (A), Arthrobacter sp. (Asp), Massilia (M), Pseudomonas (P), Rhizobium (three separate OTUs are annotated) (R), Rhodopseudomonas (Rh), Rodanobacter (Ro), Solirubrobacter (So) Stenotrophomonas (S) and Arabidopsis (A), Medicago (M), Brachypodium (B), Brassica (Br), Pisum (P), Triticum (W) and generation (1, 2, 3)
Tkacz A, Cheema J, Chandra G, Grant A, Poole PS: Stability and succession of the rhizosphere microbiota depends upon plant type and soil composition. ISME J 2015, 9:2349-2359.
