Indicadores metabólicos de comunidades bacterianas en suelos ácidos y alcalinos
Conocemos que diferentes propiedades edáficas del suelo, como el pH o el contenido y disponibilidad de nutrientes son responsables de los patrones de diversidad taxonómica en sus comunidades bacterianas. Los autores de este trabajo evalúan el impacto de distintos factores edáficos en la diversidad metabólica de las comunidades bacterianas de suelos sobre un gradiente de pH por medio de los genes encontrados en sus metagenomas totales.
Al comparar los suelos alcalinos y ácidos encuentran que la diversidad taxonómica se encuentra reducida en los suelos alcalinos, mientras que la diversidad metabólica no muestra diferencias significativas entre ambos grupos. A pesar de que en términos de diversidad los suelos ácidos y alcalinos son similares, éstos pueden ser diferenciados como dos grupos distintos, a partir de los cuales obtienen una serie de genes indicadores de cada uno y que se clasifican en las categorías de transporte de membrana, estrés, metabolismo de aminoácidos, virulencia y respiración.
Los genes indicadores de suelos ácidos corresponden a transportadores de metales y bombas de eflujo de cationes, así como diferentes proteínas de quimiotaxis, las cuales pueden estar relacionadas a las condiciones estresantes de acidez, baja disponibilidad de nutrientes y anaerobiosis. Por otro lado, los indicadores de suelos alcalinos son genes relacionados a mecanismos de adquisición más directa de carbohidratos y fijación de nitrógeno, lo que va de la mano con la mayor concentración de materia orgánica en este tipo de suelos.
Referencia:
Malik AA, Thomson BC, Whiteley AS, Bailey M, Griffiths RI. 2017. Bacterial physiological adaptations to contrasting edaphic conditions identified using landscape scale metagenomics. mBio 8:e00799-17. https://doi.org/10.1128/mBio.00799-17.
