Impacto de los gradientes de aridez en las comunidades bacterianas desérticas
Con la finalidad de estudiar los factores ambientales y geoquímicos que moldean la microbiota de las regiones áridas, se realizaron muestreos en un gradiente de aridez y vegetación de 300 km en el desierto de Atacama en Chile. Las comunidades microbianas fueron estudiadas secuenciando la región v4 del gen 16S rRNA y los parámetros ambientales principales que se consideraron fueron: la humedad relativa del suelo, el pH, la temperatura del suelo y la conductividad eléctrica.
Al analizar la diversidad (de acuerdo con los índices de Shannon y Faith), se encontró que la diversidad incrementa con en el incremento de la humedad relativa del suelo, la cual también parece ser mayor en zonas con vegetación más densa. Al utilizar pruebas de Mantel para relacionar las diferencias en las comunidades microbianas (de acuerdo con matrices de distancia Unifrac), sólo la humedad relativa presentó una correlación elevada. Análisis de redes mostraron que la humedad relativa de las muestras también se relaciona con la topología de las redes, donde los suelos más húmedos soportan comunidades más densamente conectadas, efecto que incrementa en las comunidades más áridas.
El análisis de la abundancia relativa a nivel de Phyla, muestra que existen varios Phylum (como Acidobacterias, Proteobacterias y Planctomyctes cuya abundancia está altamente correlacionada con la humedad relativa de las muestras; mientras otros grupos como las Actinobacterias son favorecidos cuando la humedad disminuye.
Análisis de beta diversidad permiten distinguir la microbiota asociada a los desiertos de la de otros ecosistemas. De éste modo, estudios como el presente, nos permiten distinguir los factores abióticos que moldean la composición de sus comunidades microbianas de los desiertos y pueden resultar de gran ayuda ante un futuro donde el cambio climático incremente las zonas áridas del planeta.
Neilson, J. W., Califf, K., Cardona, C., Copeland, A., van Treuren, W., Josephson, K. L., … & Maier, R. M. (2017). Significant Impacts of Increasing Aridity on the Arid Soil Microbiome. MSystems, 2(3), e00195-16.