Cambios en la estructura y dinámica de comunidades microbianas bajo invasión (Cuando llega tu primo, el arrimado)
Una pregunta frecuente en la ecología microbiana es, ¿qué tan efectiva puede ser la colonización de un nuevo nicho por una especie invasora? En este trabajo Mallon y colaboradores evalúan los efectos que un microorganismo invasor puede llegar a tener tanto en la composición y diversidad de una comunidad microbiana como en la forma de utilizar los recursos del nicho (amplitud y estructura del nicho). Los autores obtienen inóculos de dos distintos suelos y generan un un gradiente de diversidad por medio de diluciones del inóculo inicial para después re introducir tales mesocosmos en un suelo estéril. Los suelos son incubados por 79 días y las comunidades son muestreadas durante el tiempo de la incubación. Posteriormente, los mesocosmos son inoculados con un microorganismo invasor (E. coli) el cual es monitoreado al final del experimento. Para evaluar el nicho, los mesocosmos son probados para la asimilación de 71 fuentes orgánicas de carbono antes y después de la invasión. Los autores encuentran que la diversidad incrementa con la invasión y se asocia con cambios en la composición de la comunidad antes y después de la invasión. Se encontraron a 11 taxa que elevan su abundancia relativa después del disturbio, siendo favorecidos por este cambio. Los perfiles funcionales (asimilación de fuentes carbono) difieren entre las comunidades antes y después del tratamiento con el microorganismo invasor y parece que la amplitud del nicho (cantidad de fuentes de C utilizadas) del mesocosmos incrementa debido a la competencia que propicia el mismo. Finalmente, los autores proponen un modelo en el cual se explica cómo las invasiones, a pesar de no ser exitosas pueden inducir cambios tanto en la diversidad y estructura de una comunidad, como en el perfil funcional de la misma. Esto resulta sumamente relevante para poder inferir el efecto que muchas aplicaciones como biofertilizantes y trasplantes de microbioma pueden tener en comunidades “naturales” o “normales”
Referencia:
Mallon, C. A., Roux, X., Doorn, G. S., Dini-Andreote, F., Poly, F., & Salles, J. F. (2018). The impact of failure: unsuccessful bacterial invasions steer the soil microbial community away from the invader’s niche. The ISME journal, 12(3), 728.