El microbioma rizosférico de distintos genotipos de Populus depende principalmente del tipo de suelo de origen
Los integrantes de las comunidades microbianas del suelo pueden variar en abundancia dependiendo del contenido de nutrientes de los suelos. En este ambiente, los rizodepósitos modulan la estructura del microbioma de rizosfera de las plantas. Éstas utilizan diferentes metabolitos para llevar a cabo la interacción planta-bacteria, tales como el ácido salicílico y distintos compuestos fenólicos, los cuales tiene una mayor producción en Populus a comparación de otras plantas y se involucran en las respuestas de resistencia contra patógenos.
En este trabajo Veach y colaboradores comparan la composición y diversidad del microbioma de raíz (Bacteria, Fungi y Archaea) de doce genotipos de Populus trichocarpa que difieren en la cantidad de metabolitos secundarios relacionados al ácido salicílico en dos suelos con propiedades diferenciales en su contenido de nutrientes. En relación a la diversidad bacteriana en la rizosfera, los autores encuentran que Populus tiene diferencias dependiendo del suelo en el cual fue conducido el experimento. Particularmente, hay mayor diversidad de bacterias en suelos ricos en nutrientes, contrario al comportamiento de la diversidad de hongos, la cual es menor en este suelo.
De acuerdo a las características metabólicas de las plantas, observan diferencias en las respuestas tanto de las plantas como de los hongos y bacterias. El ácido salicílico se produjo en mayor abundancia en los suelos pobres en nutrientes, mientras que la tremuloidina tiene una mayor producción en los suelos ricos en nutrientes. A nivel de phyla, Acidobacteria, Verrucomicrobia, Chloroflexi y Gemmatimonadetes tiene una correlación positiva con el metabolito secundario populina, mientras que Firmicutes y Actinobacteria correlacionan con la tremuloidina, metabolito que también explicó las diferencias en las abundancias globales de bacteria y arquea pero sólo en uno de los suelos de origen dada la mayor producción del mismo en ese suelo.
Al comparar la composición de los microbiomas de los doce genotipos de Populus en ambos suelos encontraron que los microbiomas conforman dos grupos los cuales se separan de acuerdo al tipo de suelo en el cual se desarrollaron, poniendo en evidencia al suelo como la variable más informativa en cuanto a la composición de las comunidades microbianas.
En conclusión, los autores encuentran que existe una diferencia en la respuesta de las comunidades microbianas a las concentraciones de ácido salicílico, explicado por las diferencias del genotipo de las plantas. Sin embargo, encuentran que el primer filtro edafológico en las comunidades de suelo es el principal factor para diferenciar a los microbiomas de raíz de los distintos genotipos de plantas.
Referencia: Veach, A. M., Morris, R., Yip, D. Z., Yang, Z. K., Engle, N. L., Cregger, M. A., … & Schadt, C. W. (2019). Rhizosphere microbiomes diverge among Populus trichocarpa plant-host genotypes and chemotypes, but it depends on soil origin. Microbiome, 7(1), 76.ISO 690
