Efectos de viajes internacionales sobre el microbioma intestinal y su resistencia antimicrobiana
Una de las consecuencias de los viajes internacionales es la colonización con microorganismos resistentes a antibióticos que pueden permanecer en el viajero durante períodos largos después del viaje, incrementando su transmisión a poblaciones susceptibles. Con el fin de elucidar qué microorganismos obtienen los viajeros y durante cuánto tiempo permanecen en la microbiota intestinal, Langelier y colaboradores extrajeron DNA y RNA de muestras fecales de individuos adultos que viajaron a Asia o África por períodos de 15-60 días. El material genético se sometió a secuenciación metagenómica y, utilizando SRST2 (detecta genes y alelos a partir de secuencias cortas de WGS) y la base de datos AR- Gannot_r2, para identificar genes codificantes de ß-lactamasas.
La composición del microbioma no presentó cambios significativos en ninguno de los puntos de toma de muestra (una semana antes del viaje y una semana, 30 días y 6 meses después del viaje) pero algunos taxa sí cambiaron su abundancia, especialmente Enterobacteriaceae y Escherichia incrementaron en las muestras de una semana después de terminado el viaje. El análisis del resistoma también mostró incrementos en genes y transcritos de resistencia a antibióticos después del viaje, sobre todo de las familias de genes AmpC, CTX-M, OXA y SHV. Estos resultados se compararon con cultivo en placas con agar cromogénico para ß-lactamasas, separando los cultivos de acuerdo a la morfología de colonias e identificando a los microorganismos utilizando espectrometría de masas. Los resultados concuerdan con lo obtenido mediante secuenciación.
La colonización de las bacterias portadoras de genes para ß-lactamasas disminuyeron su abundancia después del viaje pero mantuvieron una abundancia mayor que la presentada antes del viaje, sugiriendo que viajes internacionales pueden inducir modificaciones a largo plazo en el resistoma antimicrobiano. Sin embargo, es importante tomar en cuenta que el tamaño de muestra y la diversidad de países destino debe incrementarse para poder obtener resultados más contundentes.
Langelier, C., Graves, M., Kalantar, K., Caldera, S., Durrant, R., Fisher, M., Backman, R., Tanner, W., DeRisi, J. L., Leung, D. T. (2019) Microbiome and Antimicrobial Resistance Gene Dynamics in International Travelers. Emerging Infectious Diseases. 25: 1380-1383.
