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Requisitos para ser un halófilo (estricto)

En la actualidad, se sugieren diversos mecanismos para la supervivencia de procariontes en condiciones extremas, en particular en altas concentraciones de sal. En este artículo, se realizó un análisis comparativo de genomas y proteomas de procariontes halófilos y no halófilos, para identificar las características específicas que les permiten sobrevivir en ambientes con alta concentración de…
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Infecciones por nemátodos generan cambios en las comunidades de endófitos de raíces de tomate.

En este trabajo se evalúan los cambios en las comunidades bacterianas y las funciones de endófitos en raíces de tomate cuando éstas son infectadas por nemátodos del género Meloidogyne. Al compararse contra plantas no infectadas, se encontró un decremento  en grupos bacterianos antagonistas de patógenos en plantas, específicamente Streptomycetales y Pseudomondales. Adicionalmente, se observó que…
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Filtrado de secuencias homólogas falsas positivas por medio de aprendizaje automático supervisado

Dado que los métodos heurísticos de agrupamiento de secuencias homólogas sobreestiman el número de relaciones de homología, los autores proponen una estrategia para filtrar alineamientos múltiples de secuencias de aminoácidos putativamente homólogas. Se generó un set de datos de alineamientos etiquetados como “homólogos” y “no homólogos” y a cada uno de estos se les tomaron…
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La actividad de bacterias Fe/Mn oxidantes disminuye la acumulación de As y Cd en arroz

En esta investigación se evaluó el efecto de la actividad oxidadora de hierro y manganeso llevada a cabo por bacterias en la absorción de asufre y cadmio en diversos tejidos de la planta Oryza sativa. Algunos trabajos anteriores habían descrito la formación de placas de Fe y Mn producidas por la oxidación microbiana de Fe(II)…
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Endófitos cultivables de plantas en suelos contaminados con metales. Buscando un potencial bioquímico.

Este trabajo muestra la recuperación de un gran número (>400) de aislados endofíticos de raíces y tejido aéreo de la planta Halimone portulacoides, la cual se tomo de sitios alta y medianamente contaminados con metales pesados (CR, Ni, Cu, Zn, As y Hg) así como de un sitio no contaminado. Los aislados fueron tipificados y…
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Cambios en las comunidades microbianas de acuerdo al tipo de alimentación

En humanos, se sabe que a largo plazo (semanas o meses), la dieta influencía la estructura y actividad de la comunidad microbiana que reside en el intestino. Sin embargo, no se sabe cuál es la respuesta de las comunidades microbianas a los cambios de macronutrientes a corto plazo (días). Lawrence y colaboradores, realizaron un estudio…
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Bacterias y hongos endófitos de trigo.

En este trabajo analizan la composición de endófitos en semillas de trigo desinfectadas superficialmente y posteriormente en plántulas.  Los grupos encontrados se han reportado en la literatura como promotores de crecimiento vegetal. En las semillas hay una mayor diversidad bacteriana, el genero dominante es Erwinia. Mientras que en plántulas hay una mayor diversidad de hongos…
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Influencia del microbioma en la herbivoría ejercida sobre Arabidopsis

En relación con los efectos que el microbioma ejerce sobre las características de las plantas, se estudiaron los efectos de los microbiomas obtenidos en el medio silvestre (asociados a Arabidopsis y pinos) y en cultivos (en campos de papá y maíz). Para ello, se hicieron crecer las plantas en extractos de cada microbioma y se…
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Mesa Redonda de Transferencia Horizontal de Genes

Para este viernes en el Colegio Nacional:

Estudio metagenómico en oleoductos

Un problema frecuente en las tuberías por las que se extraen hidrocarburos, es el de la corrosión provocada por el oxígeno. Una estrategia para evitar éste problema, ha sido la utilización de bisulfito de sodio, compuesto que interacciona con el oxígeno para formar sulfato.  En el artículo, se evalúa cómo la utilización constante de bisulfito…
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Factores que determinan la diversidad bacteriana de consorcios descomponedores de hojas en un sistema de corriente de agua

En este estudio se caracterizó y midió la diversidad de comunidades microbianas presentes en hojas de dos especies del género Populus, a los días 6, 14 y 28, tras iniciarse la descomposición en una corriente de agua primaria. Se evaluaron varios factores que podrían modificar la diversidad  microbiana; algunos de ellos dependientes de las especies…
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Variaciones en el microbioma de rizósfera como respuesta a deficiencia de hierro

En este trabajo se observa la variación que existe en el microbioma de rizósfrera en plantas con diferentes estrategias de adquisición de hierro (cebada y tomate). Las plantas fueron estresadas por deficiencia de este nutriente en un sistema hidropónico y cultivadas en dos suelos de características distintas, principalmente la cantidad de carbono inorgánico. Las distintas…
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Transferencia microbiana como tratamiento para la infección por Clostridium difficile

En humanos, la infección por Clostridium difficile presenta diversas complicaciones que pueden causar la muerte. Con la caracterización del microbioma sano (Proyecto de Microbioma Humano), se pueden encontrar patrones bacterianos que definan el desequilibrio en diversas patologías, en este caso, en el intestino. En este artículo, se realizaron transplantes de microbiota de pacientes sanos a…
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Estudio de bacterias magnetotácticas no cultivables mediante Single Cell Genomics

Las bacterias magnetotácticas que pertenecen a phyla basales han sido tratado de aislar sin éxito,  se han analizado metagenomas de estas comunidades, sin embargo la información que brindan estos análisis se limitan a los miembros más abundantes de dichas comunidades. Mediante una aproximación de Single Cell Genomics fue posible obtener tres drafts de genomas de bacterias…
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Compuestos volátiles bacterianos y su actividad contra Botrytis cinerea en Arabidospsis

Los compuestos volátiles bacterianos pueden actuar de diferentes formas, ya sea elicitando Respuesta Sistémica Inducida en las plantas o actuando directamente contra patógenos, en este trabajo prueban los compuestos producidos por Bacillus subtilis GB03 en Arabidopsis contra el hongo patogeno B. cinerea. En este caso encuentran que el principal papel de estos compuestos es como…
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