El suelo es un sistema complicado que puede presentar una amplia gama de condiciones contrastantes, como aireación, disponibilidad de nutrientes y pH, por lo tanto es una de los ambientes con mayor diversidad microbiológica conocidos. Los dos grandes grupos de microorganismos que habitan el suelo son los hongos y las bacterias, que además de lidiar…
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La disponibilidad de hierro en el océano es muy baja y principalmente se debe a su baja solubilidad, por lo que el consumo de hierro de los microorganismos a partir de fuentes externas está limitado. La proporción de genes involucrados con el metabolismo del hierro incrementa con la disminución de la concentración de hierro en…
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Es este trabajo Berg y Koskella trabajan con la competencia de microorganismos en la filósfera. Investigan como la microbiota de la filósfera en tomate afecta la colonización de Pseudomonas syringae (Pst). Para su estudio, inocularon con spray distintas dosis de microorganismos, aislados previamente de filósfera, a hojas de plantas de jitomate. Después de una semana…
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El presente estudio se realizó con la finalidad de comprender los factores que determinan la estructuración del microbioma de raíz en plantas de maíz. Para ello, analizaron amplicones del gen 16S rRNA de alrededor de 5 mil muestras. Las muestras colectadas correspondieron a 27 genotipos, plantados en tres localidades diferentes, que se muestrearon a partir…
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Conocer los genes que permiten el establecimiento de los microorganismos en el medio ambiente es uno de los principales objetivos de la microbiología moderna con el fin de desarrollar aplicaciones médicas, agrícolas, entre otras. Un factor importante a tomar en cuenta es la genealogía de los miembros de la comunidad, ya que organismos emparentados podrían…
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El estudio de las interacciones planta-microorganismo ofrecen una solución biológica con el potencial de impulsar la producción de alimentos. Sin embargo resulta difícil investigar estos mecanismos debido a la complejidad, la irreproducibilidad asociada. Una estrategia es construir sistemas modelo simplificados para permitir experimentos de laboratorio controlados y replicables. En este trabajo se presenta una descripción…
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Una pregunta frecuente en la ecología microbiana es, ¿qué tan efectiva puede ser la colonización de un nuevo nicho por una especie invasora? En este trabajo Mallon y colaboradores evalúan los efectos que un microorganismo invasor puede llegar a tener tanto en la composición y diversidad de una comunidad microbiana como en la forma de…
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La caracterización del microbioma de este trabajo se realizó muestreando insectos en Corea del Sur durante un lapso de 2010 a 2012, colectando 305 individuos de 218 especies de 21 ordenes. Obteniendo solamente los intestinos tanto de larvas como adultos y secuenciando el gen 16S ribosomal. Obtuvieron 174,374 secuencias agrupadas en 9,301 OTUs a 3%…
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De manera general, se sabe que la urbanización es una causa de que disminuya la biodiversidad, ejemplos se pueden observar en varios ecosistemas. Sin embargo, ¿a nivel del microbioma ocurre lo mismo? Además, diversos estudios han propuesto que las sociedades urbanas, al no estar en contacto con microorganismos del ambiente “natural”, pudieran estar teniendo un…
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La estimación de la proporción (cobertura) de la comunidad microbiana real que fue recuperada por métodos de secuenciación masiva es uno de los grandes problemas de los análisis metagenómicos, sobre todo cuando se quiere conocer la diversidad taxonómica presente en una muestra. Las mayores limitantes a la resolución de este problema es el contenido de…
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Por medio de amplicones del gen 16S rRNA, metranscriptómica y el estudio de transcritos y producción de metabolitos de raíz, Ling Xu y colaboradores estudiaron el efecto del estrés hídrico en las comunidades de bacterias asociadas a la raíz del sorgo. Considerando que el microbioma de raíz es reclutado del entorno durante el desarrollo de…
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El desarrollo de los métodos de secuenciación de alto rendimiento nos ha ayudado a tener un mejor entendimiento de la ecología microbiana, así como de la frecuencia y diversidad de genes específicos en diferentes ambientes. Sin embargo, muchas veces no está claro qué profundidad de secuenciación es necesaria para describir a la comunidad de estudio.…
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Diversos estudios indican que el microbioma de los espacios interiores está determinado por diversos factores como la localización, la arquitectura, el tipo de superficie, sistemas de ventilación, entre otros. Además, de que existen diversas fuentes de dichos microorganismos, como plantas, mascotas, ambientes exteriores y, principalmente, los humanos. No obstante, hay ambientes donde es necesario evitar…
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Pensando en la restauración de los ecosistemas, Gibbons y colaboradores estudiaron el efecto que tiene la introducción de especies invasoras en los suelos. Para ello, utilizaron como zona de estudio el Rancho MPG (área de conservación e investigación ubicada en Montana), donde analizaron las propiedades fisicoquímicas del suelo, la diversidad de plantas, de bacterias (16S…
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Las plantas pueden solubilizar fosforo inorgánico, de forma deficiente, mediante la producción de ácidos orgánicos y con ello la acidificación del suelo. Sin embargo, existen microorganismos en la rizosfera que solubilizan fósforo mediante la acidificación de ésta o promoviendo el crecimiento de root hairs incrementando así la superficie de la raíz. En este trabajo a…
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