Amplicones o Metagenómica. En el estudio de la diversidad microbiana

Amplicones o Metagenómica. En el estudio de la diversidad microbiana actualmente se utiliza la amplificación y secuenciación masiva de genes marcadores como el 16S rRNA, cuya comparación y análisis da lugar a árboles filogenéticos y un inventario de Unidades Taxonómicas Operativas (OTUs). En la metagenómica total se secuencia el total del DNA de una comunidad. Con la metagenómica total se obtienen fragmentos que pueden ser útiles para hacer perfiles taxonómicos, pero su interés radica en poder hacer análisis funcionales de los genes de una comunidad, su perfil metabólico y comparar dichas funciones con otras comunidades (Modificado de Tringe y Rubin, 2005, Nat. Rev. Genetics; J. Janson, 2011, Microbe)