Imparte la Dra. María Gloria Domínguez-Bello Departamento de Bioquimica y Microbiología y de Antropología. Profesora de la Universidad de Rutgers (NJ, USA). Viernes 15 de febrero 2019 Anfiteatro Alfredo Barrera, Facultad de Ciencias, UNAM https://goo.gl/maps/9aNhpidcmZ22 Viernes, 15 febrero de 2019 09:30-10:30 El laboratorio de la Profesora Domínguez-Bello enfoca en el estudio de la coevolución de…
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Las bacterias están presentes en cualquier tipo de ambiente. En los últimos años se le ha prestado especial atención a los microorganismos asociados a algún hospedero u ambiente y se le ha llamado a esto como la microbiota, microbiomas. Los microbiomas son, en sentido estricto, comunidades de microorganismos. Una comunidad se define en múltiples conexto,…
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Una de las novedades que implicó el uso de la secuenciación masiva en ecología microbiana fue que comenzamos a descubrir poblaciones microbianas que de otra forma no tendríamos forma de conocer. En esta revisión Michael Lynch y Josh Neufeld hacen una revisión de los métodos experimentales y como ha cambiado nuestra percepción de la diversidad…
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Ve el siguiente video: Lee las siguientes notas: https://elcomidista.elpais.com/elcomidista/2016/08/31/articulo/1472625105_953819.html http://www.gaceta.unam.mx/20170918/90-4-de-tortillas-en-mexico-contiene-maiz-transgenico/ http://www.gaceta.unam.mx/20171106/presencia-de-maiz-transgenico-de-importacion-en-mexico-20-anos-de-inocuidad-en-productos-derivados-para-consumo-humano-y-animal/ http://web.ecologia.unam.mx/laboratorios/genomica/biotech/articulos_curso/Golden_rice.pdf https://elpais.com/elpais/2016/06/30/ciencia/1467286843_458675.html http://www.elmundo.es/grafico/salud/2015/10/30/5633c8cb22601da2218b458d.html https://www.nytimes.com/es/2017/04/03/mexico-maiz-renegociacion-tlcan/ Loading… Aquí un complemento de lo que vimos en la clase: [<a href=»//storify.com/gram_positivo/alimentos-transgenicos» target=»_blank»>View the story «»Alimentos Transgénicos» J.M. Mulet» on Storify</a>]
Vamos a practicar los conceptos de filogenia. Los datos a utilizar los pueden descargar de la siguiente dirección: Después de descargarlos podemos comenzar con un clásico de los análisis filogenéticos: Phylip. Pueden revisar este manual que hizo nuestro amigo el Dr. Pablo Vinuesa: http://www.ccg.unam.mx/~vinuesa/Cursos2RMBF/PDFs/C1/Tutorial_Pablo_Vinuesa_uso_paqute_Phylip.pdf Hagan los pasos hasta conseguir un arbol de NJ Ahora bien,…
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La siguiente parte se entrega a mano el 24 de octubre de 2017 en la clase, por equipos de laboratorio: Ejercicio 1. Resuelve el siguiente ejercicio de restricción: Ejercicio 2 El siguiente es el esquema del plasmido 31416 (p31416): Las enzimas de restricción que cortan el vector se muestran a continuación, no hay ningún otro…
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El día de hoy quiero que hagan un ejercicio de genómica comparativa, un diagrama de Venn comparando el número de proteínas compartidas por al menos 4 especies de Agrobacterium que están analizando. Sugerencias: 1. Utiliza BLASTp para hacer tus comparaciones. 2. La clave está en los identificadores. 3. Un formato tabular de reporte de BLAST…
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Predicción de genes codificantes Ejercicio 1. Lee el artículo de Glimmer: https://ccb.jhu.edu/papers/glimmer2.pdf 2. Busca, que es un modelo interpolado de Markov 3. Selecciona un archivo fna (de Agrobacterium) de un cromosoma y corre la predicción de genes. Baja el siguiente script en la carpeta en la que estes trabajando: https://drive.google.com/file/d/0B7dtIr9rg974M25Wb3Zndkt6QkU/view?usp=sharing Cambia sus permisos a ejecutable:…
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Formulario respuestas Loading… Resumen del manual de blast https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279675/
