Se estima que hoy en día, el 55% de la población mundial habita zonas urbanas, lo cual tiene repercusiones importantes en la estructura y transmisión del microbioma humano. Una de las características de mayor interés en los microbiomas de las grandes urbes es que existe una alta frecuencia de genes de resistencia a antibióticos (AMR,…
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El cambio climático está afectando el estilo de vida de muchas especies, lo cual puede generar un efecto dominó ya que las que sirven de alimento podrían ver afectada su distribución o producción de biomasa. En este trabajo, Guolang Li y compañía decidieron investigar el efecto del cambio en precipitación en la composición de los…
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Nuestra nueva publicación en bioRXiv, que es un preprint server. El trabajo se encuentra sometido a revisión por pares en este momento. Marchantia liverworts as a proxy to plants basal microbiomes. Luis David Alcaraz, Mariana Peimbert, Ana E. Dorantes-Acosta, John L. Bowman, Mario A. Arteaga-Vazquez bioRxiv 103861; doi: https://doi.org/10.1101/1038613 http://biorxiv.org/content/early/2017/01/28/103861
Un reportero de Science trata de hacer CRISPR, ya que alguien le había dicho que cualquier idiota podía. Los resultados dan risa. La nota completa El video:
En esta era de metagenomas resulta común usar de argumento que las características fenotípicas, como la forma, en bacterias no nos lleva muy lejos debido a que se pueden tener falsos positivos de identificación de microorganismos. En el artículo que les propongo revisar esta semana mencionan ejemplos de esto: For example, the Betaproteobacteria Rhodocyclus tenuis…
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El hierro es clave en procesos de colonización de los microorganismos, es un nutriente esencial en la vida, con múltiples usos en la célula desde cofactor hasta el transporte de electrones. Además, tiene roles en la patogénesis y virulencia. En las interacciones entre hospedero y sus microbios en la mayoría de las ocasiones existe competencia…
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En este trabajo se realizaron experimentos en campo a lo largo de 5 años probando distintos tratamientos que simulan perturbaciones antropogénicas (adición de fertilizantes, manejo de suelo) para observar los cambios que dichas perturbaciones generan en la composición genética y filogenética de las comunidades bacterianas del suelo y ligarlos a procesos estocásticos (colonización/dispersión) o deterministas…
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Aquí la liga al pdf del acordeón de gráficos con ggplot2 en R. https://www.rstudio.com/wp-content/uploads/2015/03/ggplot2-cheatsheet.pdf
En este trabajo se evalúan los cambios en las comunidades bacterianas y las funciones de endófitos en raíces de tomate cuando éstas son infectadas por nemátodos del género Meloidogyne. Al compararse contra plantas no infectadas, se encontró un decremento en grupos bacterianos antagonistas de patógenos en plantas, específicamente Streptomycetales y Pseudomondales. Adicionalmente, se observó que…
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Para este viernes en el Colegio Nacional:
En este trabajo se observa la variación que existe en el microbioma de rizósfrera en plantas con diferentes estrategias de adquisición de hierro (cebada y tomate). Las plantas fueron estresadas por deficiencia de este nutriente en un sistema hidropónico y cultivadas en dos suelos de características distintas, principalmente la cantidad de carbono inorgánico. Las distintas…
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El mismo Darwin estudió estas plantas y observó que las trampas de Utricularia y sus fluidos una vez que capturaban la presa se tornaban de un color obscuro hasta que el animal quedaba literalmente fuera de la vista. Darwin en su libro Insectivorous plants (1865), describe que tiene la sospecha de que las trampas secretan algún tipo de…
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