Cambios en la diversidad rizosférica en estaciones de lluvias y de secas
Se cree que una baja disponibilidad de agua en la rizósfera puede evitar su colonización y el flujo de nutrientes. Además, los cambios fisiológicos que experimenta la planta pueden cambiar los patrones de exudado de fotosintatos. Estos fenómenos podrían estar modificando la composición del microbioma rizosférico en temporadas de secas y de lluvias. Por lo tanto, Vanessa Kavamura y compañía estudiaron los patrones de diversidad microbiana en la rizósfera del cactus Cereus jamacaru en dos estaciones distintas a nivel local en una zona semiárida en el noreste de Brasil, por medio de la secuenciación de DNA metagenómico. En época de lluvias, la clase Alphaproteobacteria seguida de Betaproteobacteria y Actinobacteria fue la más abundante. Las clases Acidobacteriia, Gammaproteobacteria y Acidimicrobiia fueron exclusivas de esta estación. Por otro lado, en la estación seca la clase más abundante fue Actinobacteria, seguida de Alphaproteobacteria, aunque con frecuencias menores. Las categorías funcionales que cambiaron en estas dos estaciones estuvieron relacionadas con el metabolismo de aminoácidos, carbohidratos, proteínas, respiración y RNA. Las comunidades de la estación de lluvias presentaron una mayor diversidad pero una menor riqueza de especies, mientras que las comunidades de secas mostraron una diversidad beta mayor de taxa pero menor de funciones. Se encontró que las comunidades se ensamblan de acuerdo a un modelo neutral con la excepción de las funciones de comunidades de lluvias, que presentan evidencias de que cada especie es diferente desde el punto de vista morfológico y fisiológico. Los autores atribuyen las diferencias observadas a que en épocas de secas, la baja disponibilidad de agua crea comunidades microbianas aisladas que mantienen redundancia metabólica para tolerar las condiciones adversas como el flujo reducido de nutrientes y la dispersión limitada.
Kavamura, V. N., Taketani, R. G., Ferreira, C., de Melo, I. S., & Mendes, R. (2018). The role of species turnover in structuring bacterial communities in a local scale in the cactus rhizosphere. Plant and Soil, 1-12.
