Ya hace más de 10 años se hizo un primer intento de hacer una filogenia de bacterias utilizando información de genomas completos, esto con el bemol de que al usar la información de los genomas completos siempre se termina comparando los genes ortólogos compartidos absolutamente por todos los organismos a comparar. Esta publicación fue la…
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La transformación natural en bacterias, es un mecanismo de transferencia horizontal de genes. Se ha sugerido que el pili es una estructura que, entre otras funciones, une DNA extracelular y lo transloca activamente a través de la membrana. Por otro lado, un modelo alternativo propone que el pili actúa como “guardian” para abrir un poro…
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El género Caulobacter ha sido históricamente aislado de ambientes acuáticos y por ende descrito como un microorganismo con un estilo de vida oligotrófico. En este trabajo, Willhelm realiza un meta análisis de estudios donde se caracterizan microbiomas por medio de bibliotecas de amplicones del gen rRNA 16S y también metagenomas completos. El objetivo del estudio…
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Se sabe que el efecto de los metales sobre la homeostasis celular depende mucho de la dosis a la que las células han sido expuestas y de los mecanismos que regulan su interacción, los cuales pueden variar de un organismo a otro. Como caso particular, la exposición a compuestos metálicos altera la diversidad y…
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Una de las cuestiones más importantes en el análisis de datos metagenómicos es la inferencia de la composición de la comunidad microbiana, es decir las abundancias relativas de los organismos muestreados. Tradicionalmente, este se lleva a cabo alineando las lecturas o contigs con secuencias genómicas o de proteínas en bases de datos. Sin embargo, con…
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En el estudio de la restauración ecosistémica, poco se sabe de la diversidad de diversidad de los microorganismos del suelo y su impacto en el ciclaje de nutrientes desde un punto de vista vertical, es decir que considere la profundidad del suelo. Con esa pregunta en mente, los investigadores del presente estudio, analizaron la diversidad…
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Los tardígrados, también conocidos como osos de agua, son metazoarios famosos por su capacidad de sobrevivir la desecación y la congelación. A pesar de ser objeto de estudio para mecanismos moleculares, poco se sabe a cerca de los microorganismos que habitan a este animal. En este estudio, los autores se preguntaron (entre…
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Al ser el hierro el cuarto elemento más abundante de la corteza terrestre, no es de extrañarse que sea fundamental en el mantenimiento de las comunidades bacterianas del suelo y de ambientes sedimentarios; en otras palabras, el hierro representa un requerimiento fisiológico para la vida. Desde la Tierra primitiva, el hierro fue relevante en la…
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En este trabajo, se analizó la microbiota asociada a la raíz del frijol común de dos cultivares distintos, que difieren en su capacidad para resistir la invasión del hongo patógeno Fusarium oxysporum, con una variedad considerada como “susceptible” y la otra como “resistente”. Para abordar el problema utilizaron un enfoque metatranscriptómico, el cual les permitió…
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El suelo es un sistema complicado que puede presentar una amplia gama de condiciones contrastantes, como aireación, disponibilidad de nutrientes y pH, por lo tanto es una de los ambientes con mayor diversidad microbiológica conocidos. Los dos grandes grupos de microorganismos que habitan el suelo son los hongos y las bacterias, que además de lidiar…
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La disponibilidad de hierro en el océano es muy baja y principalmente se debe a su baja solubilidad, por lo que el consumo de hierro de los microorganismos a partir de fuentes externas está limitado. La proporción de genes involucrados con el metabolismo del hierro incrementa con la disminución de la concentración de hierro en…
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Es este trabajo Berg y Koskella trabajan con la competencia de microorganismos en la filósfera. Investigan como la microbiota de la filósfera en tomate afecta la colonización de Pseudomonas syringae (Pst). Para su estudio, inocularon con spray distintas dosis de microorganismos, aislados previamente de filósfera, a hojas de plantas de jitomate. Después de una semana…
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El presente estudio se realizó con la finalidad de comprender los factores que determinan la estructuración del microbioma de raíz en plantas de maíz. Para ello, analizaron amplicones del gen 16S rRNA de alrededor de 5 mil muestras. Las muestras colectadas correspondieron a 27 genotipos, plantados en tres localidades diferentes, que se muestrearon a partir…
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Conocer los genes que permiten el establecimiento de los microorganismos en el medio ambiente es uno de los principales objetivos de la microbiología moderna con el fin de desarrollar aplicaciones médicas, agrícolas, entre otras. Un factor importante a tomar en cuenta es la genealogía de los miembros de la comunidad, ya que organismos emparentados podrían…
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