Con un estudio de biología de sistemas alrededor del microbioma de Arabidopsis thaliana, Mathew T. Agler y compañía estudiaron la dinámica de la filosfera tomando en cuenta factores bióticos y abióticos. Los grupos estudiados fueron bacterias, hongos y oomicetes, y observaron que las comunidades microbianas en estos microecosistemas están reguladas principalmente por organismos ¨meollo¨, los…
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Este algoritmo, llamado SeMeta, agrupa las lecturas metagenómicas por empalme y por cada grupo, asigna una serie de lecturas de referencia, las cuales serán las únicas utilizadas como secuencias problema para llevar a cabo la búsqueda de homólogos en bases de datos. Los hits de cada búsqueda son filtrados por bit-score y por sus frecuencias…
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En este estudio se comparó la diversidad y el potencial genético de las comunidades microbianas por medio de metagenómica en seis secciones de un jal minero producido por la extracción de Pb y Zn. Estas secciones se encontraban en distintas etapas de la formación de drenaje ácido de minas. Las zonas con poca acidificación mostraron…
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