Las bases de datos de la Enciclopedia de Kyoto de Genes y Genomas (KEGG) son ampliamente usadas para analizar genomas y metagenomas bacterianos por su información detallada y la posibilidad de analizar rutas metabólicas visualmente. En el portal de internet de esta institución, existen servicios de anotación de secuencias como son el BlastKoala, GhostKoala y…
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La llegada de colonos europeos a las Américas a partir del siglo XV, contribuyó a la propagación de nuevos virus entre los pueblos indígenas. Esto llevó a brotes masivos de enfermedades y millones de muertes que causaron el colapso de una importante población nativa. Se desconocen los virus exactos que causaron estos brotes. En este estudio, los…
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Las bacterias pertenencientes al grupo CPR (“Candidate Phyla Radiation”) suelen presentar genomas y células pequeñas, algunas de menos de 1 Mbp y 0.2 μm. Recientemente Moreira y colaboradores (2021), analizaron el genoma de una especie del grupo a la que nombraron Vampirococcus lugosii, en honor a Bela Lugosi, actor reconocido por su famosa interpretación de…
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Dentro de sus hábitats los microorganismos no se presentan aislados, sino que interactúan con otras especies. Las moléculas secretadas a menudo juegan un papel crucial en estas interacciones microbianas para garantizar la supervivencia. Dentro de este marco ecológico, muchos rasgos microbianos solo pueden establecerse mediante la cooperación de varios organismos. En este sentido, algunas moléculas…
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La composición de las comunidades de microorganismos asociadas a raíces de plantas está influenciada por muchos factores, tales como las condiciones ambientales, las propiedades fisicoquímicas del suelo, las comunidades de microorganismos presentes en el suelo y el genotipo y estado de desarrollo de la planta hospedero. En este estudio, los autores analizan las comunidades rizosféricas…
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Las bacterias del suelo interactúan con otros microorganismos de diversas formas, algunas de las cuales resultan benéficas para las plantas. Uno de éstos tipos de interacción es la depredación, la cual puede ser de tipo endobiótica (como sucede en el caso de Bdellovibrio) o epibiótica. Cuando es epibiótica, la célula depredadora establece contacto con la…
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Las plantas tienen la capacidad de liberar fotosintatos, a través de su raíz, hacia la hacia la rizosfera. Cuando las plantas se encuentran en una relación simbiótica con micorrizas una gran parte de los fotosintatos se asigna a los hongos que a cambio liberan nutrientes para la planta. Por otro lado, las hifas micorrízicas producen…
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Se ha reportado que el microbioma asociado a plantas es seleccionado por la planta hospedero. Recientemente se ha reconocido que la composición del microbioma depende en realidad de tres factores: el hospedero, los microorganismos y el ambiente. Con el fin de profundizar y analizar las relaciones entre estos tres factores, Roman-Reyna y colaboradores extrajeron de…
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La lignina es uno de los componentes principales de las biomasa de las plantas y se estima que de hecho es el segundo biopolímero más abundante en la naturaleza. A pesar de ser un compuesto fenólico, puede ser degradada vía enzimática por hongos y bacterias, además de servir como fuente de carbono. Hoy en día,…
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Este trabajo se realizó con la finalidad de entender la manera en que el microbioma de la semilla y el microbioma del suelo influyen en la estructuración del microbioma de las plantas. Para ello colectaron más de 200 suelos en un amplio rango espacial de sitios con y sin cultivos, a partir de los cuales…
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La aplicación de fertilizantes juega un papel muy importante en el aumento de la producción agrícola. El uso excesivo de fertilizantes puede disminuir la cantidad de materia orgánica en el suelo, acelera su acidificación y puede reducir el desempeño de los cultivos. En solución a esto, se ha propuesto la implementación de microorganismos benéficos y…
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Una de las consecuencias de los viajes internacionales es la colonización con microorganismos resistentes a antibióticos que pueden permanecer en el viajero durante períodos largos después del viaje, incrementando su transmisión a poblaciones susceptibles. Con el fin de elucidar qué microorganismos obtienen los viajeros y durante cuánto tiempo permanecen en la microbiota intestinal, Langelier y…
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Se estima que hoy en día, el 55% de la población mundial habita zonas urbanas, lo cual tiene repercusiones importantes en la estructura y transmisión del microbioma humano. Una de las características de mayor interés en los microbiomas de las grandes urbes es que existe una alta frecuencia de genes de resistencia a antibióticos (AMR,…
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La minería aporta buena parte de los materiales necesarios para mantener nuestro estilo de vida: la producción de dispositivos electrónicos (como el que está usted usando para leer este texto), utensilios médicos y maquinaria dependen de ella. Uno de los métodos más empleados en la actualidad es la minería a cielo abierto, que consiste en…
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Hace poco tiempo publicamos el trabajo principal de la tesis doctoral de Hugo Barajas donde probamos el modelo más importante de colonización de bacterias en raíces de plantas, el modelo de dos pasos. A continuación lo explico: Si quieren leer el artículo completo se encuentra en: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2020.542742/full Este trabajo lo presentamos en el congreso MicrobiomeMX…
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