Trabajando en la Universidad de Sonora en el laboratorio de nuestra amiga la Dra. Corina Hayano
Trabajando en la Universidad de Sonora en el laboratorio de nuestra amiga la Dra. Corina Hayano
en el campo, en el proyecto de fitoestabilización de jales mineros!
en el campo, en el proyecto de fitoestabilización de jales mineros! Luis David Alcaraz originally shared:en el campo, en el proyecto de fitoestabilización de jales mineros!
Calificaciones teoría Biotecnología
Estimados, aquí van sus calificaciones hasta la fecha. Como se mencionó al inicio del curso los exámenes tienen un valor del 60%, tareas y trabajos del 30% y finalmente se califica la participación y asistencia (10%). Sus calificaciones son las estimadas. Para dudas y aclaraciones agendar cita el lunes 7 de diciembre a partir de…
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Biotecnología reposiciones
Para hacer las reposiciones es necesario llevar una identificación oficial. Loading…
Bioinformática, evaluación curso
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Bioinformática 17 de noviembre
Ejercicios de RNAseq. Vamos a utilizar R y Bioconductor. El ejercicio de hoy consiste en tratar de llevar a cabo el análisis de RNAseq descrito a continuación: http://www.bioconductor.org/help/workflows/rnaseqGene/ Traten de trabajar con los ejemplos incluidos en los paquetes. Si descargan los fastq y hacen los alineamientos desde cero pueden tardar mucho tiempo. Tengan cuidado de…
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Biotecnología: Presentaciones finales 2015
La próxima semana (martes 17 de noviembre) tendremos un seminario, por equipo tienen que revisar los artículos que pueden descargar del siguiente vínculo: https://drive.google.com/file/d/0B7dtIr9rg974TS1ielVvbEczX1U/view?usp=sharing La distribución de los artículos es la siguiente: Equipo 1 (García Romero, Rivera, Aguilera, Olvera) – The american Chetnut’s Genetic rebirth Equipo 2 (Raymundo Alonso, Luis, Janet, José…
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Bioinformática ensamble
Lee el siguiente primer: http://www.cbcb.umd.edu/research/assembly_primer Explica: ¿Qué es la cobertura de secuenciación? ¿Qué utilidad tiene la ecuación Lander-Waterman? ¿Porqué se originan errores de ensamblado en regiones repetitivas? ¿Qué es un contig? ¿Qué es un scaffold? ¿Qué diferencia hay entre un ensamblador de tipo Greedy y un Overlap-layout-consensus? ¿Qué es un camino Hamiltoniano? ¿Qué es un…
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Bioinformática 3 de noviembre
Vamos a practicar los conceptos de filogenia. Los datos a utilizar los pueden descargar de la siguiente dirección: http://132.247.90.91/bioinfo/filogenia/ Después de descargarlos podemos comenzar con un clásico de los análisis filogenéticos: Phylip. Pueden revisar este manual que hizo nuestro amigo el Dr. Pablo Vinuesa: http://www.ccg.unam.mx/~vinuesa/Cursos2RMBF/PDFs/C1/Tutorial_Pablo_Vinuesa_uso_paqute_Phylip.pdf Hagan los pasos hasta conseguir un arbol de NJ…
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Bioinformática práctica 27 octubre
Anotación. El objetivo de la práctica del día de hoy será generar la anotación de las predicciones de genes de los ejercicios anteriores (Glimmer), si no puedes usar el archivo ffn concatenado de cromosoma + plásmidos, con la base de datos del COG (Cluster of Orthologous Groups). Además de usar lo ya aprendido con cd-hit,…
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Bioinformática, filogenias
Mis estimados: Para la siguiente sesión hay que leer el capítulo «Reconstrucción de la historia de cambio de los caracteres». En este capítulo, el Dr. León Martínez Castilla logra recapitular varios conceptos que hemos estado revisando en clase. El libro completo lo pueden descargar del sitio del inecc o conseguir una edición impresa:…
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Nota del trabajo de nuestros colaboradores
Nota del trabajo de nuestros colaboradores Pseudomonas aeruginosa, bacteria presente en el ambiente | gaceta Digital UNAMPseudomonas aeruginosa es una bacteria presente en el ambiente, patógena para el humano y otros mamíferos. Estamos expuestos a ella pero no todos enfermamos por su motivo; esto depende de cómo se encuentra nuestro sistema inmunológico. Sólo si tenemos…
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Biotecnología 1 Tarea (entrega 26 de octubre)
Estimados, si quieren estudiar para el examen pueden descargar el siguiente PDF con todo lo que hemos visto en esta sección, solamente estará disponible por esta semana (aprovechen): Loading…
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