Biotecnología, Tarea 4
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Revisar el siguiente artículo: Pushker, R., Mira, A., & Rodriguez-Valera, F. (2004). Comparative genomics of gene-family size in closely related bacteria. Genome Biol, 5(4), 0. Lo pueden descargar de la siguiente dirección: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC395786/pdf/gb-2004-5-4-r27.pdf Tratar de hacer la gráfica #1 del artículo usando 3 genomas/proteomas de Agrobacterium que hemos estado usando en el curso. Trata de…
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Pueden accesar aquí a las fórmulas: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1zEof8gFHER7NN0gxNJV7HHTuGht734xhmmai8B5jM_8/edit?usp=sharing *Gracias a su compañera Mirelle Flores
Vamos a determinar los ortólogos presentes entre dos especies de Agrobacterium Es una actividad por equipos (2 o 3 personas máximo). De las lecturas de BLAST y de revisar el artículo siguiente: Moreno-Hagelsieb, G., & Latimer, K. (2008). Choosing BLAST options for better detection of orthologs as reciprocal best hits. Bioinformatics (Oxford, England), 24(3), 319–24.…
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Sobre bitácoras de laboratorio Ten Simple Rules for a Computational Biologist’s Laboratory Notebook
Tienes que ver el siguiente video:
Tienen hasta el lunes 7 de septiembre (11:59 p.m.) para poder entregar la tarea.
Llena el formulario de abajo con los comandos que utilizaste y las respuestas a lo que se pide: *Lecturas para la siguiente sesión: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10195279 *Lectura del BLAST https://www.dropbox.com/s/y5imiep2ksfyks4/Problem%20solving%20handbook%20in%20computational%20biology%20and%20bioinformatics.BLAST.pdf?dl=0 *Puedes consultar los manuales y las aplicaciones disponibles en: http://emboss.sourceforge.net/apps/cvs/emboss/apps/index.html Utiliza wossname y encuentra programas que te permitan evaluar y manipular secuencias. Busca un programa dentro…
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need to fight back in other ways… The Golden Age of Antibiotics is OverWe’ve all heard about antibiotic resistant bacteria. It’s time to admit, we’re losing this war. Drug resistant superbugs like MRSA (Methicillin-resistant Straphylococcus aureus), CRE (Carbapenum-re…
Grupo 5308, 25 lugares. Profesor Luis David Alcaraz Peraza ma 14:30 a 17:30 Profesor Ángela Victoria Forero Forero vi 14:30 a 17:30 Al ser una clase teórica-práctica es requisito aprobar ambas partes. La calificación final será el promedio entre la parte teórica y el trabajo en el laboratorio. La parte teórica será evaluada así: 60%…
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Tiempo de entrega finalizado
La lista con los aceptados al curso es la siguiente: Tendremos una sesión informativa el próximo martes 4 de agosto a las 9 a.m. en el aula de cómputo del Instituto de Ecología. A los que no fueron aceptados al curso se debe a la gran demanda del curso y a limitaciones de espacio. El…
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How much DNA is out there? 5.3 × 10^31 megabases (Mb) Although, the authors didn't considered gene redundancy… An Estimate of the Total DNA in the BiosphereThe diversity of life on Earth is typically considered in terms of the total number of species. However, this essay, by estimating the total amount of DNA in the…
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CRISPR, la revolución en ingeniería genética, dicen que desde la invención del PCR no se había visto algo así… También trae nuevos dilemas regulatorios. CRISPR, the disruptorA powerful gene-editing technology is the biggest game changer to hit biology since PCR. But with its huge potential come pressing concerns.
IV Congreso de Bioquímica y Biología Molecular de Bacterias http://ift.tt/1JsE3lT el congreso se llevará a cabo en Atlixco/Metepec, en el estado de Puebla del 4 al 8 de octubre del presente año Junio 30 fecha límite para envío de resumen y cuota con dcto.