Categoría: journal club

Probando la promoción del crecimiento vegetal de una bacteria endófita de desierto con herramientas genómicas y microbiológicas

Dado el cambio climático que se está experimentando en la actualidad, se espera que las zonas áridas y semi áridas del globo se expandan, lo cual es un problema para la agricultura. En la última década, el desierto se ha convertido en un sitio de muestreo de bacterias que estén adaptadas a la escasez de…
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Relación entre los metabolitos secundarios y el microbioma de raíz

Se considera que las plantas poseen la capacidad de modular el reclutamiento de microorganismos que forman parte de su microbiota de raíz, en un proceso en el que participan metabolitos primarios y secundarios. Existe un grupo de metabolitos secundarios conocidos como benzoxazinoides, grupo de compuestos derivados del triptófano y que son producidos en grandes cantidades…
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Las bacterias fijadoras de N y su papel en la colonización de plantas invasoras en contaminación por metales pesados.

Las especies invasoras de plantas (IPS) pueden generar variaciones en las comunidades microbianas de la rizosfera debido a la retroalimentación planta-suelo y así aumentar la probabilidad de una colonización exitosa, el éxito de la colonización también esta ligado a la disponibilidad de N en los suelos por lo tanto las bacteria fijadoras de N (SNB)…
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Influencia del tipo de cultivo sobre el microbioma y fisiología de la planta

Las comunidades microbianas del suelo son clave para la nutrición, desarrollo e inmunidad de las plantas. Sin embargo, las prácticas agrícolas podrían favorecer cierta composición de los microorganismos asociados a las plantas. Se ha descrito que las plantas cultivadas en monocultivos presentan menor diversidad microbiana en la rizosfera. Sin embargo, el efecto del monocultivo no…
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Influencia del genotipo de plantas e inoculantes externos en la composición del microbioma de rizósfera

Las bacterias presentes en la rizósfera de plantas pueden cumplir distintos roles ecológicos y se piensa que  la composición de dicho microbioma es dependiente de la especie o genotipo de las plantas debido a los distintos perfiles de señales químicas que las raíces pueden producir y que funcionan como atractores (fuentes de carbono) para las…
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La transferencia horizontal de genes explica en gran medida la supervivencia a concentraciones extremas de metales pesados en Acidithiobacillus

El género Acidithiobacillus está compuesto de bacterias Gram-negativas quimiolitotróficas y debido a que oxidan compuestos inorgánicos de azufre, han sido utilizadas para llevar a cabo biolixiviación de minerales. Bacterias de este género se encuentran en drenaje ácido de minas en donde comúnmente hay concentraciones tóxicas de metales pesados como Hg, Cu y Co, y metaloides…
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Potencial genético de comunidades bacterianas para aprovechar el fósforo orgánico en diferentes condiciones de pH

Para superar la baja biodisponibilidad de fósforo, las bacterias poseen la capacidad experimentar una respuesta reguladora y fisiológica que resulta en la secreción de varias exoproteínas involucradas en la liberación y unión del Pi.  Las exoenzimas mayormente secretadas comprenden a las fosfatasas ácidas (ACPasas) y las fosfatasas alcalinas (APasas), que escinden el ortofosfato de diversos…
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El crecimiento de las plantas y su influencia en las comunidades de Rizobacterias.

Se sabe que las plantas y los microrganismos interactúan entre ellos, especialmente con las bacterias de la rizosfera, las cuales son necesarias para un buen desarrollo y salud de las plantas. Esta interacción entre las plantas y las rizobacterias (bacterias de la rizosfera) es muy estrecha ya que las comunidades microbianas dependen tanto del tipo…
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Cómo recuperar 150,000 genomas a partir de metagenomas

La metagenómica trata de describir comunidades microbianas enteras mediante la secuenciación masiva de DNA. Sin embargo, la mayor parte de la secuenciación depende de lecturas de DNA relativamente cortas, aunque esto va en mejoría con híbridos del tipo PacBio o el Oxford Nanopore. El reto consiste en armar estos rompecabezas en unidades discretas, si se…
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Relación entre las bacterias resistentes a antibióticos y los suelos contaminados con metales pesados.

Las bacterias pueden volverse resistentes a los antibióticos debido a las mutaciones o la adquisición de genes de resistencia de otras bacterias, dentro de las bacterias que habitan en los suelos, las bacterias que portan plásmidos están más presentes en suelos contaminados que en otras áreas. En ambientes contaminados ya se han documentado evidencias de…
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La dinámica social entre microorganismos marinos se relaciona con la producción de sideróforos

Una estrategia común entre los microorganismos que viven en ambientes con disponibilidad de hierro limitada, es la secreción de sideróforos, los cuales pueden unirse al hierro poco soluble y ponerlo a disposición de las células a través de mecanismos de transporte activo. Tales complejos sideróforos-hierro pueden considerarse como bienes públicos, ya que pueden ser explotados…
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Caracterización de propiedades ligninolíticas de comunidades bacterianas en suelos forestales

La despolimerización y degradación de lignina en los suelos es un proceso caracterizado principalmente en hongos y algunos grupos bacterianos pero se conoce poco sobre la contribución de diferentes taxa a nivel de comunidades microbianas completas. En este trabajo realizan un estudio metagenómico vía secuenciación de bibliotecas de amplicones y metagenomas totales en experimentos de…
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La guerra entre bacterias y hongos que ocurre en la endósfera de raíz, favorece el crecimiento de las plantas

La microbiota de raíz está compuesta por diversos grupos de microorganismos, como las bacterias, los hongos y los protistas. Con el objetivo de entender éstas interacciones, el presente trabajo de Durán y colaboradores, analizó la diversidad de dichos grupos en raíces de Arabidopsis thaliana por medio de amplicones del gen 16S rRNA en bacterias y…
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El papel de los exudados de raíz en el microbioma

En ambientes naturales las plantas dependen de interacciones complejas con comunidades dinámicas. Las comunidades asociadas a la raíz pueden influenciar la salud y crecimiento de las plantas, en este sentido se ha propuesto que los exudados de la raíz juegan un papel importante en la estructuración de las comunidades microbianas de la rizosfera y endosfera.…
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Diferencias en adecuación inicial: el factor decisivo en la guerra por la dominancia en comunidades bacterianas

La ecología teórica incorpora procesos que creemos que tienen un papel importante en la estructuración de las comunidades: selección, deriva, dispersión y especiación. En la actualidad existe el debate sobre qué tan importante es el efecto de la selección sobre la biodiversidad, de manera que los modelos que no la incorporan son llamados modelos neutrales.…
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