Categoría: journal club

Existe una amplia diversidad de microorganismos que colonizan diferentes partes de una planta como, por ejemplo, las hojas. Los microorganismos son capaces de sintetizar una variedad de compuestos naturales bioactivos que generalmente están involucrados en la guerra química. En este trabajo los autores utilizan una colección de 224 bacterias con genomas secuenciados que fueron previamente…
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El glifosato es un  herbicida  utilizado a nivel mundial para el control de malezas, se usa en conjunto con cultivos genéticamente diseñados para ser resistentes. Su  objetivo es inhibir la enzima 5-enolpiruvilshikimato-3-fosfato  sintasa (EPSPS) en la ruta del shikimato que se encuentra en las plantas y algunos microorganismos. Previene la biosíntesis de aminoácidos aromáticos y otros…
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Los números de la Enzyme Commission (EC) representan un sistema ontológico que define y organiza las funciones enzimáticas en un lenguaje amigable tanto para humanos como para computadoras. Existen cuatro niveles en esta clasificación, el más general tiene 6 categorías: oxidorreductasas, transferasas, hidrolasas, liasas, isomerasas y ligasas. Los dos niveles siguientes representan subcategorías mientras que…
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Pseudomona aeruginosa tiene diferentes sistemas para detectar y secuestrar el hierro en su entorno, que le posibilitan la formación de biofilms y factores de virulencia, los cuales pueden determinar su relación con el hospedero. Esta bacteria patógena es capaz de mediar la adquisición y almacenamiento del hierro a través de una variedad de factores reguladores…
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La descomposición de la materia orgánica vegetal es un paso muy importante en el ciclo de carbono. Uno de los componentes principales de la biomasa vegetal es la lignocelulosa, que se compone de celulosa, hemicelulosa y lignina, en cuya degradación participan multiples enzimas de las denomidas CAZymes (Carbohydrate-Active enZYmes). En éste proceso participan hongos, bacterias…
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Se ha visto que las plantas, mediante sus exudados radiculares, reclutan un microbioma de rizósfera que puede ayudar al crecimiento de la planta o a la contención de infecciones por patógenos y al mismo tiempo, las plantas pueden dejar un legado en la composición de la comunidad microbiana del suelo, generando suelos supresivos de enfermedad.…
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Con la finalidad de entender el efecto del cambio climático en las comunidades de microorganismos, los autores de éste trabajo realizaron un estudio longitudinal de la diversidad de bacterias (por medio del gen 16S rRNA) y de hongos (por medio de ITS) en un experimento de cambio climático. Dicho experimento se realizó a lo largo…
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Las plantas tienen respuestas a diferentes tipos de estrés como la herbívora. Se ha sugerido que los mecanismos de respuesta se encuentran mediados por especies reactivas de oxígeno,  cambios en la concentración de Ca2+ y señales eléctricas dependientes de receptores tipo glutamato (GRL). Toyota y colaboradores observaron, por primera vez, cómo plantas de Arabidopsis responden…
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Las  oxidorreductasas son enzimas que generalmente tienen tamaño pequeño, son altamente diversas en sus secuencias de aminoácidos y destacan por encargarse de reacciones de transferencia de electrones y facilitar el flujo del hidrógeno, carbono, nitrógeno, oxígeno y azufre en la Tierra, por lo que muchas veces requieren en sus sitios activos la presencia de metales…
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Las bacterias están presentes en cualquier tipo de ambiente. En los últimos años se le ha prestado especial atención a los microorganismos asociados a algún hospedero u ambiente y se le ha llamado a esto como la microbiota, microbiomas. Los microbiomas son, en sentido estricto, comunidades de microorganismos. Una comunidad se define en múltiples conexto,…
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Un tema frecuente en el estudio de la evolución de la cooperación mutualista en poblaciones naturales es la aparición de mutantes “egoístas”, que han perdido genes involucrados en la simbiosis, los cuales compiten con los simbiontes mutualistas por los recursos del hospedero. Las bacterias del género Mesorhizobium comúnmente forman asociaciones mutualistas con legumbres, y sus…
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Cuando se estudia genética y evolución nos enseñan sobre el poder de las mutaciones y como el balance de las mismas con otras fuerzas evolutivas tienen impactos en los individuos y las poblaciones. Cuando pensamos en mutaciones, casi siempre pensamos en el efecto queda y se debe a alteraciones en el DNA genómico y es…
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La influencia del genotipo de hospedero, el ambiente y del tipo de suelo se han reportado como fuentes de variación de las comunidades microbianas en las raíces de las plantas. En este artículo Schlaeppi y colaboradores se dedicaron a investigar la diversidad de la microbiota con un enfoque filogenético a través de tres especies del…
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Lotus japonicus es una especie capaz de establecer relaciones simbióticas con bacterias fijadoras de nitrógeno y formar nódulos. Para analizar el efecto de la pérdida de la capacidad para formar nódulos, en la estructuración de su microbiota de raíz (considentando muestras de suelo, rizósfera, endósfera y nódulos), se utilizaron amplicones del gen 16S rRNA para…
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La biotecnología y la biología sintética nos han permitido manipular microorganismos de manera que podamos aprovechar sus capacidades. Uno de los problemas que presentamos es que hay necesidad de «domesticar» a las bacterias para poder realizar ingeniería genética y tenemos la limitante de la transferencia del DNA hacia un nuevo huésped bajo condiciones óptimas de…
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