El microbioma rizosférico está involucrado en la supresión de patógenos, entre otras funciones. La mayor parte de los estudios de este tipo de comunidades microbianas se centran en el análisis de bacterias y hongos que puedan conferir resistencia ante microorganismos que causen enfermedad en las plantas. Sin embargo, otros microorganismos, como los protistas, tienen la…
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El método MEMPIS permite identificar genes y reacciones metabólicas específicas a ciertas condiciones mediante la incorporación de perfiles metabólicos y de expresión de genes. Sin embargo, no permite establecer las conexiones entre los genes específicos de ciertas condiciones (GEC) y otros genes, así como el papel que juegan en la respuesta del microbioma que se…
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El cambio en la composición de las comunidades microbianas que ocurre en el suelo respecto a la rizósfera y la endósfera de raíz, se conoce como efecto rizósferico. Debido a que algunas plantas presentan ciclos de vida más largo que otras, se cree que dichas diferencias podrían impactar en el efecto rizosférico, teorizándose que éste…
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Bactrocera tryoni (mosca de la fruta de Queensland) es una mosca tefrítida distribuida por toda la costa de Australia y una plaga molesta de muchos tipos de cultivos de fruta. ya que se conocía que la composición bacteriana de estas moscas en de enterobacterias en estudios dependientes de cultivo. Los autores tratan de comprender con…
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La contaminación por metales pesados (MP) cada vez aumenta más debido a las actividades humanas. Los MP, no se degradan por lo que tienden a persistir en el ambiente por largo tiempo. EL Zinc (Zn) es un MP que puede resultar fitotóxico si se encuentra en grandes cantidades en el suelo. Aunque existen plantas que…
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El análsis de comunidades microbianas por secuenciación masiva ya sea por amplificación del gen de rRNA 16S o por secuenciación de metagenoma total implica muchas veces buscar genes o taxa con abundancia diferencial bajo ciertas condiciones. Estas comparaciones frecuentemente se hacen usando herramientas diseñadas para analizar datos de conteos como transcriptomas obtenidos por RNAseq. Recientemente…
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El genotipo de la planta es capaz de regular la resistencia a insectos herbívoros alterando la acumulación de metabolitos primarios y secundarios. Por ejemplo, los glucosinolatos (GLS) son metabolitos secundarios que impiden que los insectos continúen alimentándose de las hojas de la planta. A pesar de que se conoce el efecto del genotipo de la…
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El microbioma de las plantas se encuentra relacionado a su estado de salud mediante efectos directos o indirectos. La supresión de patógenos es uno de los mecanismos por los cuales se mejora el estado de salud de las plantas. La mayoría de los estudios de microbiomas buscando a microorganismos supresores se han centrado en el…
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El polvo transportado atmosféricamente desde el desierto del Sahara proporciona pulsos de nutrientes que son biológicamente indsipensables y que se depositan en las aguas superficiales de los océanos. La respuesta biológica a estos eventos efímeros no ha sido profundamente explorada, es por ello que en este trabajo desarrollado por Westrich y colaboradores decidieron examinar el…
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Uno de los problemas más frecuentes por los que pasan los seres vivos que habitan en el suelo, es el estrés hídrico, cuyos efectos en la microbiota no son del todo comprendidos. Por este motivo, los autores del presente trabajo estudiaron la microbiota del suelo de bosque de encino (Quercus ilex), en un diseño experimental…
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Gran parte de los organismos que componen una comunidad microbiana se encuentran en baja abundancia. En la mayoría de los análisis por secuenciación metagenómica, los fragmentos genómicos que se logran armar pertenecen a los organismos dominantes, mientras que las secuencias de los organismos de baja abundancia son escasas. Una forma de recuperar contigs de estos…
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El cultivo de cítricos se lleva a cabo desde hace aproximadamente 4000 años. El género Citrus se cultiva en 140 países diferentes, implicando un amplio rango biogeográfico, produciendo hasta 122 millones de toneladas anuales. Debido a esto, el International Citrus Microbiome Consortium (2015) ha realizado el esfuerzo de muestrear suelos y rizosferas de 12 variedades…
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Una de las estrategias más usadas para la caracterización de las comunidades, es secuenciar genes que están altamente conservados como el 16S rRNA. El cual es un marcador taxonómico y se utiliza mucho para determinar la abundancia relativa de los grupos de bacterias presentes en una comunidad. Sin embargo, las funciones metabólicas de las comunidades…
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En muchas bacterias la producción de sideróforos está regulada por la detección de quórum (QS), que es un mecanismo de regulación de la expresión génica dependiente de la densidad celular. Las células involucradas son capaces de producir y detectar moléculas de señalización extracelular, llamadas autoinductores, que inducen la expresión génica colectiva y son un indicador…
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El cultivo de plantas para investigación se realiza utilizando medios sólidos que emulen el suelo pero que son demasiado opacos para fines de investigación, además de que ofrecen un control limitado de las características que afectan al desarrollo de raíces. Como alternativa se ha usado hidroponía y aeroponía pero no representan las condiciones de cultivo…
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