Categoría: Laboratorio

Microorganismos biorremediadores de jales mineros

La minería aporta buena parte de los materiales necesarios para mantener nuestro estilo de vida: la producción de dispositivos electrónicos (como el que está usted usando para leer este texto), utensilios médicos y maquinaria dependen de ella. Uno de los métodos más empleados en la actualidad es la minería a cielo abierto, que consiste en…
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El microbioma perdido con la domesticación de plantas

Hace poco tiempo publicamos el trabajo principal de la tesis doctoral de Hugo Barajas donde probamos el modelo más importante de colonización de bacterias en raíces de plantas, el modelo de dos pasos. A continuación lo explico: Si quieren leer el artículo completo se encuentra en: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2020.542742/full Este trabajo lo presentamos en el congreso MicrobiomeMX…
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Curso de microbiología por twitter

Hoy comienza el curso de microbiología por twitter, desde las 3 p.m. (Hora Ciudad de México). Aquí la historia del curso de hoy, muy emocionante: [View the story «Curso de microbiología en Twitter #microMOOCSEM2» on Storify] #microMOOCSEM2 Tweets

Una buena guía para generar una variedad de gráficos en R

Aquí la liga al pdf del acordeón de gráficos con ggplot2 en R.   https://www.rstudio.com/wp-content/uploads/2015/03/ggplot2-cheatsheet.pdf

Mesa Redonda de Transferencia Horizontal de Genes

Para este viernes en el Colegio Nacional:

Nuestra nueva publicación: El metagenoma de una planta carnívora

El mismo Darwin estudió estas plantas y observó que las trampas de Utricularia y sus fluidos una vez que capturaban la presa se tornaban de un color obscuro hasta que el animal quedaba literalmente fuera de la vista. Darwin en su libro Insectivorous plants (1865), describe que tiene la sospecha de que las trampas secretan algún tipo de…
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Uso de técnicas de expresión génica mediada por inductores como herramienta para identificación de genes de interés provenientes de suelos contaminados.

Este trabajo presenta una técnica detallada para la captura de genes relacionados a la degradación de hidrocarburos aromáticos y poliaromáticos a partir de DNA metagenómico de suelos contaminados estos compuestos. La identificación de dichos genes se basa en la inducción por substrato (hidrocarburos aromáticos) en bibliotecas de clonas, las cuales son separadas por citometría de…
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Posición Postdoctoral en Genómica Bacteriana

Estamos buscando un candidato motivado para incorporarse como postdoc para un proyecto que involucra el estudio de interacciones múltiples bacteria-bacteria utilizando RNASeq. El candidato seleccionado se incorporará a un proyecto financiado por Conacyt (Fronteras de la Ciencia).  La duración del postdoc es de 12 meses con opción a renovación por un segundo período de 12…
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Analysis and characterization of cultivable heavy metal-resistant bacterial endophytes isolated from Cd-hyperaccumulator Solanum nigrum L. and their potential use for phytoremediation

Este trabajo reporta bacterias endófitas aisladas de una planta hiperacumuladora de Cd que presentan actividades promotoras de crecimiento vegetal y son resistentes a metales pesados. Encontraron que 4 cepas aisladas son capaces de colonizar, realizaron ensayos para evaluar el crecimiento y la acumulación de metales en tejidos vegetal de plantas germinadas de semillas inoculadas con…
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Shifts in microbial community composition and function in the acidification of a lead/zinc mine tailings

En este estudio se comparó la diversidad y el potencial genético de las comunidades microbianas por medio de metagenómica en seis secciones de un jal minero producido por la extracción de Pb y Zn. Estas secciones se encontraban en distintas etapas de la formación de drenaje ácido de minas. Las zonas con poca acidificación mostraron…
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De las bitácoras de laboratorio

Lean el siguiente artículo y a tener al día las bitácoras! PLOS Computational Biology: Ten Simple Rules for a Computational Biologist’s Laboratory Notebook http://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1004385

Adaptation of soil microbial community structure and function to chronic metal contamination at an abandoned Pb-Zn mine

En este trabajo realizaron un análisis espacial de la estructura de las comunidades de microorganismos de suelos contaminados metales pesados (Pb, Zn y Cd) al obtener el metatranscriptoma de zonas con contamiación baja, media y alta. Encontraron que los factores fisicoquímicos que determinaban la estructura de las comunidades microbianas fueron la concentración de metales, el…
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Transplanting soil microbiomes leads to lasting effects on willow growth, but not on the rhizosphere microbiome.

Este trabajo estudia la relación existente entre razgos fenotípicos contrastantes (diferencias en talla, biomasa y plantas que murieron) en plantas del género Salix spp. crecidas en suelos contaminados con petróleo y el microbioma de rizósfera, planteando un panorama de heredabilidad de estos razgos por medio de la inoculación de microbioma a una segunda generación de…
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