Análisis del microbioma y metaboloma para identificar especies claves en la infección de Clostridium difficile.
Este artículo realiza un análisis intregral del microbioma y metaboloma a fin de identificar especies indicadoras de bacterias intestinales asociadas con los niveles de colesterol y coprostanol en pacientes con infección de Clostridium difficile (CDI). Esta infección se caracteriza por el desequilibrio del microbioma intestinal y del metaboloma fecal.
Se conoce que altas concentraciones de colesterol y bajas de coprostanol afecta el estado de CDI y que estas concentraciones pueden estar reguladas por bacterias particulares, sin embargo, se desconocen.
Este estudio propone una metodología que puede ser empleada para la determinación de otros metabolitos con otro tipo de muestras como por ejemplo muestras de suelo. Con las muestras de este estudio emplean espectrofotometría de masa y secuenciación del gen 16S rRNA y realizaron asociaciones empleando el spearman rank de pacientes con la infección y sanos como control. También emplean NMDS (non-metric multidimensional scaling) las determinar a las bacterias asociadas con altos niveles de coprostanol y colesterol empleando el Indicator Species Analysis (ISA).
