Los estudios de la microbiota oral se han centrado en estudio descriptivos o de interacciones duales entre microorganismos. En este trabajo desarrollan un modelo in vitro a fin de conocer como interactúa Candida albicans un hongo comensal presente en bajas cantidades en cerca del 70% de la población saludable. Para esto cultivan un pool de…
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El mal de Chagas es una infección causada por el parasito Tripanosoma cruzi, y transmitido por la picadura un triatomino (chipo o chinche). En este articulo publicado por investigadores de la Universidad de Yucatán, México, en febrero del presente año, intentan tener una aproximación más integral a la epidemiología de esta infección explorando asociaciones entre…
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En este artículo desarrollado por computólogos y biólogos de la Universidad de Oxford exploran como varía la arquitectura de colonias bacterianas con morfologías de cocos y bacilos durante su dinámica de crecimiento. Parten de la idea de que las morfología existentes son el resultado de adaptaciones evolutivas en respuesta a un ambiente. Para su estudio…
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En este artículo parten de la hipótesis de que la presencia helmintos puede aumentar la fertilidad en la mujer dado que la respuesta inmune que generan es similar a durante el embarazo. Para probar esta hipótesis los investigadores diseñan un estudio logitudinal en el que durante 9 años toman muestras muestra fecales de 986 mujeres…
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En este estudio parten de la hipótesis de que las funciones metabólicas del ser humano están gobernadas por la periodicidad del ritmo circadiano y por lo tanto las comunidades bacterias deben responder a estas variaciones. Este estudio describe los cambios el microbioma salivar en humanos a nivel taxonómico y funcional a lo largo de 3…
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Desde hace años se ha reportado asociaciones del microbioma intestinal y el cebrero, por ejemplo, su influencia en el estado de ánimo, en el autismo, en el control del apetito, etc. Sin embargo, el fuerte vinculo de la dieta como principal moldeador del microbioma humano ha permanecido como un factor de confusión. En este trabajo…
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En este articulo que les comparto buscan explicar la utilidad de los indices de diversidad y la mejor manera de realizar los análisis entre los grupos que estemos comparando. La idea es lograr identificar el tipo de análisis que requieren tus datos según el diseño de tu estudio (Ej. temporal o transversal). Para elegir la…
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Este nuevo marco de analisis de diversidad emplea los números de Hill como medidas de diversidad. Los números de Hill o número efectivo de especies son transformaciones de otras medidas de diversidad que permite trabajar con valores comparables entre muestras. En este protoloco se trabaja con 3 ordenes. Número de Hill de orden 0 (q=0)…
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En este estudio publicado en 2016 en Plos One, identifican 3 bacteriofagos promisorios para tratar a ciertas cepas patogénicas de E. coli. Los bacteriofagos son virus capaces de infectar a bacterias, multiplicarse en su interior y lisarla (virus míticos). Tienen la característica de ser altamente específicos en su infección incluso a nivel de variedades a…
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La secuenciación de alto redimiendo consta múltiples protocolos. Para cada uno de estos se han desarrollado varias metodologías, lo cual puede significar que los resultados de un estudio no puedan ser comparables con los de otro. En este paper comparan el impacto de estas metodologías en las misma data. Observan que el factor con el…
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Este estudio publicado en enero de 2016, por primera vez demuestran la existencia de reloj biológico en procariota fuera del filum Cyanobacteria. Para esto aislaron Enterobacter aerogenes (E.a), un comensal de la microbiota intestinal y lo cultivan a diferentes concentraciones de melatonina, observando que su mejor crecimiento está en concentraciones similares a las del intestino…
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En este estudio comparan el viroma y el microbioma de 10 personas con infección urinaria y 10 sanas. Para esto purificaron la fracción de virus en 1ml de orina y posteriormente los secuenciaron en un chips de 314 puestos en Ion Torrent. Se filtran las secuencias de bacterias y humanas de las de viruses. Para…
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Este artículo publicado en 2015, presenta un método de incorporación de data de microbioma y metabolitos recogidos de la piel humana en mapas en 3D que facilita la visualización y el establecimiento de correlaciones entre ambas datas. Los sujetos de su estudio son un hombre y una mujer que han pasado 3 días sin bañarse…
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En general, el microbioma vaginal de las mujeres sanas está dominado por Lactobacillus sp. Se ha reportado que la presencia de Lactobacillus crispatus disminuye 5 veces la probabilidad de presentar vaginosis bacteriana (BV), un estado de alta diversidad bacteriana con sintomatología. Este estudio busca identificar las cepas de Lactobacillus crispatus presentes en las mujeres sanas…
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Este artículo realiza un análisis intregral del microbioma y metaboloma a fin de identificar especies indicadoras de bacterias intestinales asociadas con los niveles de colesterol y coprostanol en pacientes con infección de Clostridium difficile (CDI). Esta infección se caracteriza por el desequilibrio del microbioma intestinal y del metaboloma fecal. Se conoce que altas concentraciones de…
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