Examen parcial Biotecnología
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Aquí pueden consultar las observaciones a sus examenes:
La siguiente parte se entrega a mano el lunes 8 de mayo en la clase, por equipos de laboratorio: Ejercicio 1 El siguiente es el esquema del plasmido 31416 (p31416): Las enzimas de restricción que cortan el vector se muestran a continuación, no hay ningún otro sitio de corte en el vector: Un gen W…
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Haz el siguiente mapeo de restricción: El mapeo de restricción se entrega en una hoja en físico. Parte dos de la tarea: Hacer un ensayo con las implicaciones y opiniones que tengas después del siguiente video: Loading…
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Hoy comienza el curso de microbiología por twitter, desde las 3 p.m. (Hora Ciudad de México). Aquí la historia del curso de hoy, muy emocionante: [View the story «Curso de microbiología en Twitter #microMOOCSEM2» on Storify] #microMOOCSEM2 Tweets
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Estimad@s, Por aquí van a tener que revisar y contestar casi todas las actividades del semestre. En esta ocasión les pido que hagan un control de lectura (máximo 1 cuartilla) de las siguientes páginas web: http://elcomidista.elpais.com/elcomidista/2016/08/31/articulo/1472625105_953819.html http://elcomidista.elpais.com/elcomidista/2014/01/30/articulo/1391061600_139106.html Las entradas del curso pueden ser revisadas bajo la etiqueta 2017-2 Biotecnología (http://web.ecologia.unam.mx/laboratorios/genomica/?cat=122) Que se encuentra…
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El Selenio (Se) se utiliza como micronutriente en muchos organismos, en pequeñas dosis, se conoce su papel en la homeostasis redox. Se utiliza inclusive cómo agente preventivo en quimioterapias. Hay tres formas biológicas de Se: Selenocisteina (Sec); 5 metilaminometil 2-selenouridina (mnm5SE2U o SeU) y; en forma de cofactor (Se-cofactor) utilizado en enzimas de procariontes que…
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En esta era de metagenomas resulta común usar de argumento que las características fenotípicas, como la forma, en bacterias no nos lleva muy lejos debido a que se pueden tener falsos positivos de identificación de microorganismos. En el artículo que les propongo revisar esta semana mencionan ejemplos de esto: For example, the Betaproteobacteria Rhodocyclus tenuis…
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El premio Nobel de fisiología-medicina (2016) fue otorgado a Yoshinori Oshumi por sus descubrimientos en la Autofagia. En el artículo de revisión que les propongo esta semana se define a la autofagia como la vía celular que entrega proteínas citoplásmicas y organelos a los lisozomas para su degradación. Que siempre sucede a una tasa basal,…
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En esta ocasión se entrega a mano para el martes 27 de septiembre, por equipos el siguiente ejercicio:
En el artículo de mis amigos Alejandro Manzano y Amparo Latorre se presenta un análisis genómico del proceso de erosión genómica al que se ven sometidas las bacterias que se vuelven simbiontes obligados, de tal manera que se pierden las funciones redundantes y no esenciales de los genes codificados en sus genomas. Es un buen…
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Ensamblado $wget https://github.com/dzerbino/velvet/archive/master.zip Entra al directorio donde descargaste Velvet. Descomprime velvet (unzip) entra a velvet-master lee el contenido de README.txt compila el programa entra al directorio tests ¿Cuántas secuencias tiene el archivo reads.fq.gz? Ejecuta el siguiente comando: $fastqc reads.fq.gz Ejecuta: $firefox reads.fq_fastqc/fastqc_report.html ¿Qué se genera? Ejecuta: $evince ../Manual.pdf & $ ../velveth ensamble 31 -fastq.gz -short reads.fq.gz $../velvetg…
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