Autor: Jonas Aguirre

Posgrado: Lecturas Jueves 27 de marzo

Tienen que leer los de mitocondrias y hacer un sólo ensayo de los dos artículos. Complete Mitochondrial Genomes of Ancient Canids Suggest a European Origin of Domestic Dogs O. Thalmann,1* B. Shapiro,2 P. Cui,3 V. J. Schuenemann,4 S. K. Sawyer,3 D. L. Greenfield,5 M. B. Germonpré,6 M. V. Sablin,7 F. López-Giráldez,8 X. Domingo-Roura,9† H. Napierala,10…
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Posgrado: Lecturas martes 25

Para el martes tienen que leer el artículo de cloroplasto y hacer un ensayo: Reconstruction of the Ancestral Plastid Genome in Geraniaceae Reveals a Correlation between Genome Rearrangements, Repeats, and Nucleotide Substitution Rates Mao-Lun Weng,*,1 John C. Blazier,1 Madhumita Govindu,1 and Robert K. Jansen1,2 2013 El artículo está en la liga de dropbox  

Posgrado: Sesión 20 Marzo

Hoy utilizaremos el paquete Adegenet de R. En el tutorial que les comenté les dicen como trabajar con una base de datos ejemplo. Si quieren podrán trabajar con esa base. Para los que quieran manipular un poco más, les dejo otra base de datos con la que podrán trabajar. Esa está en la linea siguiente.…
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Posgrado: Funciones básicas de R

Les subo las funciones que vimos ayer en el curso. No pude adjuntar el archivo así que se los copio aquí. Estas nos servirán para hacer la práctica de mañana. Por favor mañana traigan instalado R y las librerías siguientes: adegenet, ape, hierfstat, genetics y vegan. En el archivo de texto dice como instalarlas. En…
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Posgrado: lectura jueves 20 de febrero

Emerson D. et al.2013.Comparative genomics of freshwater Fe-oxidizing bacteria: implications for physiology, ecology, and systematics. Frontiers in Microbiology. doi: 10.3389/fmicb.2013.00254

Posgrado: lectura martes 18 de Febrero

Karin Holmfeldt , Howard-Varona, Solonenko, Sullivan. 2014. Contrasting genomic patterns and infection strategies of two co-existing Bacteroidetes podovirus genera. Environmental Microbiology