1. Lee el siguiente primer: http://www.cbcb.umd.edu/research/assembly_primer Explica: ¿Qué es la cobertura de secuenciación? ¿Qué utilidad tiene la ecuación Lander-Waterman? ¿Porqué se originan errores de ensamblado en regiones repetitivas? ¿Qué es un contig? ¿Qué es un scaffold? ¿Qué diferencia hay entre un ensamblador de tipo Greedy y un Overlap-layout-consensus? ¿Qué es un camino Hamiltoniano? ¿Qué es…
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Modelos ocultos de Markov Consulta el manual de HMMEr: http://eddylab.org/software/hmmer3/3.1b2/Userguide.pdf Describe las funciones relacionadas a hmmer: hmmalign hmmconvert hmmlogo hmmscan hmmstat hmmbuild hmmemit hmmpgmd hmmsearch hmmc2 hmmfetch hmmpress hmmsim Genera un modelo oculto de markov con el alineamiento generado la semana pasada (ejercicio 3) en hmmer Cuando tengas el alineamiento y el modelo oculto de…
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Formulario respuestas Loading… Resumen del manual de blast https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279675/
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Estimad@s alumnos: Completen el siguiente tutorial de Linux para que practiquen lo visto en clase. http://ryanstutorials.net/linuxtutorial/ Por favor vayan adelantando la lectura de BLAST. Pueden descargar de la siguiente liga: https://drive.google.com/file/d/0B4yYJADlEqTnbS01OUNpMTFJWDQ/view?usp=sharing En la parte inferior encontrarán el formulario en donde pegarán sus respuestas de la tarea. Recuerden, tienen que incluir tanto la respuesta como el…
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Puedes contestar el examen en este sitio o en la siguiente liga Loading…
Aquí pueden consultar las observaciones a sus examenes:
La siguiente parte se entrega a mano el lunes 8 de mayo en la clase, por equipos de laboratorio: Ejercicio 1 El siguiente es el esquema del plasmido 31416 (p31416): Las enzimas de restricción que cortan el vector se muestran a continuación, no hay ningún otro sitio de corte en el vector: Un gen W…
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Haz el siguiente mapeo de restricción: El mapeo de restricción se entrega en una hoja en físico. Parte dos de la tarea: Hacer un ensayo con las implicaciones y opiniones que tengas después del siguiente video: Loading…
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Hola, tienes hasta el 21 de marzo (8 p.m.) para contestar la tarea. Loading…
