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Microbioma especializado de una planta halófita y transplantes en plantas no halófitas

En este artículo caracterizan el microbioma de una planta halotolerante Suaeda salsa y analizan su microbioma tanto por secuenciación del gen 16S rRNA, como de ITS para hongos. Se explora la hipótesis de que hay un microbioma seleccionado por parte de la planta en la condición de alta salinidad. En este artículo toman algunos de los…
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2017-1 Biotecnología Tarea 5

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Competencia entre L. iners y G. vaginalis por epitelio vaginal.

Existen diversos estudios que han caracterizado la microbiota del tracto vaginal. En estos se ha encontrado, que para mantener la salud del tracto genital femenino es importante que exista una baja diversidad bacteriana y que predominen especies del género Lactobacillus. Sin embargo, se desconoce a nivel funcional como es que estas comunidades bacterianas mantienen el…
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Comparación del Lactobacillus crispatus de mujeres sanas con mujeres con vaginosis bacteriana

En general, el microbioma vaginal de las mujeres sanas está dominado por Lactobacillus sp. Se ha reportado que la presencia de Lactobacillus crispatus disminuye 5 veces la probabilidad de presentar vaginosis bacteriana (BV), un estado de alta diversidad bacteriana con sintomatología. Este estudio busca identificar las cepas de Lactobacillus crispatus presentes en las mujeres sanas…
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Colonización de S. aureus en mucosa nasal

S. aureus es una bacteria comensal en el humano que puede ser un factor de riesgo en infecciones invasivas en hospitales; la nariz es el microhábitat preferido de esta bacteria. Aunque se ha observado que la microbiota de la nariz es similar al de la piel, la mayoría de los estudios existentes sobre la microbiota…
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2017 Biotecnología Tarea 4

En esta ocasión se entrega a mano para el martes 27 de septiembre, por equipos el siguiente ejercicio:

Inóculos de suelo como herramienta para la restauración ambiental

El presente trabajo busca analizar el efecto que tiene la inoculación del suelo en el establecimiento de las comunidades vegetales durante el proceso de sucesión ecológica. Para realizar el estudio, se utilizó un campo de cultivo de más de 60 años de antigüedad, que se dividió en parcelas a las que se les arrancó la…
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Estudiando interacciones microbianas en un sistema sintrófico: La disponibilidad de recursos modula la naturaleza de las mismas

Este trabajo tuvo por objetivo estudiar la interacción mutualista entre dos levaduras en un sistema sintrófico donde cada cepa suplementaba  un aminoácido esencial a la otra. Se realizaron monocultivos y co-cultivos de las cepas las cuales se marcaron con RFP (Leu-) y YFP (Trp-). Después de 24 horas de crecimiento se realizaba una dilución 1/10,…
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La composición del micriobioma de tomate es más influenciada por variaciones edáficas que por tratamientos de fertilización.

Entre las prácticas de fertilización de campos de cultivo más comunes se encuentra la adición de fertilizantes de origen animal y vegetal que son una fuente de microorganismos benéficos o patógenos en el microbioma de las plantas. En este trabajo se analiza la influencia que distintos fertilizantes, orgánicos y sintéticos tienen en el microbioma de…
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Análisis del microbioma y metaboloma para identificar especies claves en la infección de Clostridium difficile.

Este artículo realiza un análisis intregral del microbioma y metaboloma a fin de identificar especies indicadoras de bacterias intestinales asociadas con los niveles de colesterol y coprostanol en pacientes con infección de Clostridium difficile (CDI). Esta infección se caracteriza por el desequilibrio del microbioma intestinal y del metaboloma fecal. Se conoce que altas concentraciones de…
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Revisita al genoma de Bacillus pumilus SAFR-032

Bacillus pumilus, una especie que forma endosporas, ocurre naturalmente en los sistemas de raices de plantas de importancia comercial. Sorprendentemente, sus esporas presentan altas tasas de sobrevivencia al ser expuestas a condiciones espaciales en la Estación Espacial Internacional. Por su resistencia a la desecación y radiación B. pumilus SAFR-032 se ha clasificado como un organismo…
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Comunidades microbianas de cadáveres en descomposición

Se sabe que el proceso de descomposición de un cuerpo está mediado por microorganismos, sin embargo, se desconoce sobre los grupos taxonómicos y la influencia de sus funciones en los ciclos de nutrientes (C,N). Metcalf y colaboradores, caracterizaron la comunidad microbiana en cádavares de ratones y humanos en descomposición, así como en diferentes tipos de…
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Como se reduce un genoma bacteriano cuando está en una relación íntima con su hospedero

En el artículo de mis amigos Alejandro Manzano y Amparo Latorre se presenta un análisis genómico del proceso de erosión genómica al que se ven sometidas las bacterias que se vuelven simbiontes obligados, de tal manera que se pierden las funciones redundantes y no esenciales de los genes codificados en sus genomas. Es un buen…
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Genómica evolutiva a lo largo de 50,000 generaciones

En esta entrega del experimento de evolución a largo plazo, se reportan las tendencias de genómica evolutiva de 12 poblaciones de Escherichia coli creciendo en un medio homogéneo. Los autores investigaron qué fracción de mutaciones nuevas presentes en un linaje son benéficas, para ello secuenciaron el genoma de dos clonas de todas las poblaciones cada…
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