Blog

Biotecnología 1. Tarea 8 (Entrega límite el viernes 2 de mayo)

En Brasil se van a liberar mosquitos transgénicos para combatir el dengue. Lee la siguiente nota completa: http://sociedad.elpais.com/sociedad/2014/04/27/actualidad/1398621840_044945.html En el siguiente esquema se trata de explicar la forma en la que funcionan. 1. Consigue información arbitrada y publicada del tema, al menos 3 publicaciones. Utiliza los siguientes servidores para hacerlo: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed http://scholar.google.com.mx/ *Pista, uno de…
Leer más

Biotecnología 1. Tarea 7.

Repaso para el examen, puede ser entregado hasta el lunes 28 de abril: Haciendo una biblioteca de cDNAs clonas los fragmentos de cDNA hacia un sitio único de restricción EcoRI en el vector. Identificas el vector recombinante que consideras que tiene el gen de interès.   1. ¿Cómo puedes usar el sitio de restricción EcoRI…
Leer más

Lectura 24/04/2014

Lean el artículo de DeMita et al. 2013 sobre métodos de detección de genes candidatos. Se llama 8 métodos_review… No hagan ensayo, leanlo con detalle. Bajen todos los archivos que están en la carpeta de Dropbox. Haremos una pequeña práctica. Saludos, Jonás

Lectura 22/04/2014

Dejen aquí sus comentarios de la lectura Saludos,  

ayuda con heatmaps

Hola hace un tiempo hice este post para tener idea de como manipular y hacer heatmaps:   http://ldalcaraz.blogspot.mx/2012/07/como-hacer-un-heatmap-y-extraer.html#.U0bfpaYjuIC   Pienso que les puede ser de utilidad…

Posgrado: Lectura 10 abril

La lectura es Rinke C. et al. 2013. Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter Nature 449: 431-437. Hagan un ensayo Saludos,

Posgrado: Lectura 8 abril

Les recuerdo que en la pagina de Dropbox ya está el documento de word con la lista de lecturas pendientes. Seguiré anunciando las lecturas para que puedan subir sus comentarios. El siguiente artículo es Eaton, D. A. R. y Richard H. Ree. 2013. Inferring Phylogeny and Introgression using RADseq Data: An Example from Flowering Plants…
Leer más

Posgrado: Lectura para el Jueves 3 de abril

Ya subí el artículo de los murciélagos. Está el link de Dropbox. Tienen que hacer un ensayo  

Posgrado: Lectura martes 1 de abril

Tienen que leer el artículo del genoma del chile  y hacer un ensayo. Ya lo subi al archivo de dropbox. Saludos,  

Posgrado: Liga a la carpeta de Dropbox

En está carpeta encontrarán lo que hicimos en R. También iré subiendo los artículos que leeremos. https://www.dropbox.com/sh/4hm6xvaqty6q1pq/YL9mqqDjkM

Posgrado: Lecturas Jueves 27 de marzo

Tienen que leer los de mitocondrias y hacer un sólo ensayo de los dos artículos. Complete Mitochondrial Genomes of Ancient Canids Suggest a European Origin of Domestic Dogs O. Thalmann,1* B. Shapiro,2 P. Cui,3 V. J. Schuenemann,4 S. K. Sawyer,3 D. L. Greenfield,5 M. B. Germonpré,6 M. V. Sablin,7 F. López-Giráldez,8 X. Domingo-Roura,9† H. Napierala,10…
Leer más

Posgrado: Lecturas martes 25

Para el martes tienen que leer el artículo de cloroplasto y hacer un ensayo: Reconstruction of the Ancestral Plastid Genome in Geraniaceae Reveals a Correlation between Genome Rearrangements, Repeats, and Nucleotide Substitution Rates Mao-Lun Weng,*,1 John C. Blazier,1 Madhumita Govindu,1 and Robert K. Jansen1,2 2013 El artículo está en la liga de dropbox  

Biotecnología 1: Tarea 6

La tarea la puedes descargar de la siguiente liga: https://copy.com/JoAZWANb649q Las respuestas se reciben como comentarios en esta entrada. La fecha límite de entrega es el miércoles 26 de marzo, antes de la clase.    

Posgrado: Sesión 20 Marzo

Hoy utilizaremos el paquete Adegenet de R. En el tutorial que les comenté les dicen como trabajar con una base de datos ejemplo. Si quieren podrán trabajar con esa base. Para los que quieran manipular un poco más, les dejo otra base de datos con la que podrán trabajar. Esa está en la linea siguiente.…
Leer más

Posgrado: Funciones básicas de R

Les subo las funciones que vimos ayer en el curso. No pude adjuntar el archivo así que se los copio aquí. Estas nos servirán para hacer la práctica de mañana. Por favor mañana traigan instalado R y las librerías siguientes: adegenet, ape, hierfstat, genetics y vegan. En el archivo de texto dice como instalarlas. En…
Leer más