En este trabajo se exploran las diferencias de la diversidad de comunidades bacterianas de raíces de dos genotipos de algodón cultivadas en dos suelos, uno rico en nutrientes y otro pobre, el cual ha sido usado para el monocultivo de la especie. Además prueban el efecto del estado de desarrollo de la planta, desde plántula…
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Para determinar el efecto de la adecuación, la selección ejercida por diversos ambientes y las interacciones que se establecen entre hospederos y huéspedes, se utilizaron 101 cepas de Ensifer meliloti que se ensamblaron dentro de una comunidad artificial. La comunidad artificial fue inóculada en cuatro distintos ambientes: dos asociados a plantas (género Medicago) y dos…
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El desarrollo de nuevas técnicas para el diagnóstico de enfermedades ha retomado importancia desde que se ha convertido un problema de salud pública la detección precisa y oportuna de microorganismos (generalmente bacterias) causantes de enfermedades, principalmente cuando se trata de enfermedades nosocomiales, aunado a que la cada vez más frecuente resistencia a antibióticos que presentan…
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En este artículo los autores demuestran que Azospirillum brasilense puede viajar desde la raíz de una planta de frijol hasta los tejidos reproductivos y así ser trasmitida de forma vertical. A. brasilense es una bacteria que habita la rizosfera y es utilizada en biofertilizantes como un promotor de crecimiento. Se sabe que puede fijar nitrógeno y…
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En este artículo parten de la hipótesis de que la presencia helmintos puede aumentar la fertilidad en la mujer dado que la respuesta inmune que generan es similar a durante el embarazo. Para probar esta hipótesis los investigadores diseñan un estudio logitudinal en el que durante 9 años toman muestras muestra fecales de 986 mujeres…
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El análisis de datos metagenómicos se basa comúnmente en la reconstrucción de fragmentos genómicos, predicción de genes y su comparación con secuencias contenidas en las bases de datos. Sin embargo, tanto el ensamblado como la búsqueda contra secuencias conocidas (anotación) es un procedimiento lento y computacionalmente costoso. En este trabajo, se propone la aplicación del…
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Determinando el microbioma y principalmente el microbioma intestinal del mosquito An. gambiae a través de los diferentes estadios de desarrollo, los autores identificaron las diferencias entre la diversidad de cada uno de los estadios y la importancia de los diferentes grupos de bacterias en cada etapa del desarrollo. Los autores explican que durante las diferentes…
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En este artículo de revisión publicado en el año 2012 en Nature Reviews, los autores Steven H. Spoel and Xinnian Dong (NATURE REVIEWS /IMMUNOLOGY, VOLUME 12, FEBRUARY 2012), hacen una revisión bibliográfica muy completa de los mecanismos por los cuales las plantas han desarrollado un sistema inmune frente a patógenos bacterianos, el cual las capacita…
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El olfato es un sentido que ayuda a percibir el ambiente, degustar alimentos y detectar peligro. El sistema olfativo está mediado por receptores situados en el epitelio olfatorio. En este estudio Koskinen y colaboradores caracterizaron el microbioma nasal de personas con olfato normal (normosmics), personas con buen olfato (good normosmics) y personas con deficiencia en…
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En este estudio parten de la hipótesis de que las funciones metabólicas del ser humano están gobernadas por la periodicidad del ritmo circadiano y por lo tanto las comunidades bacterias deben responder a estas variaciones. Este estudio describe los cambios el microbioma salivar en humanos a nivel taxonómico y funcional a lo largo de 3…
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Los humanos que vivimos en la sociedad moderna, pasamos, en promedio, 90% de nuestro tiempo en espacios interiores, y varios estudios han identificado que en dichos interiores como escuelas, casas, oficinas y hospitales, coexisten comunidades de microorganismos (bacterias, hongos y virus) que van cambiando tanto en abundancia, como en composición. Gracias a los avances en…
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En un intento de romper las barreras y limitaciones de las comparaciones entre secuencias del gen rRNA 16S para definir unidades taxonómicas ecológicamente relevantes, McMahon y colaboradores investigan los patrones de heterogeneidad genómica a nivel de poblaciones bacterianas en metagenomas de lagos a lo largo de 5 años, utilizando 33 genomas correspondientes a dos linajes…
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El arroz es un cultivo que se produce en condiciones de inundación. Por ello y por su importancia alimenticia, en éste trabajo lo utilizan para estudiar los cambios en las comunidades microbianas asociadas a raíz bajo condiciones estrés hídrico. Se emplearon amplicones del gen 16S rRNA para estudiar la microbiota de cuatro variedades de arroz…
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Los virus son un componente fundamental de las comunidades microbianas y gracias a las técnicas de secuenciación masiva ha sido posible identificarlos en muestras ambientales. Sin embargo, detectar nuevos linajes víricos es problemático ya que no cuentan con secuencias homólogas en las bases de datos de anotación. Con este problema en mente, Mauricio Barrientos y…
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Una de las novedades que implicó el uso de la secuenciación masiva en ecología microbiana fue que comenzamos a descubrir poblaciones microbianas que de otra forma no tendríamos forma de conocer. En esta revisión Michael Lynch y Josh Neufeld hacen una revisión de los métodos experimentales y como ha cambiado nuestra percepción de la diversidad…
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