Categoría: journal club

Transmisión vertical en el microbioma del abejorro

El microbioma intestinal de abejas y abejorros se caracteriza por comunidades sencillas pero con una alta diversidad a nivel de cepa. Además se ha observado que entre estas cepas pueden haber diferencias en la presencia y ausencia de genes que podrían ser muy importantes a nivel funcional para sobrevivir en este ambiente. En este trabajo,…
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Microbioma fúngico del sapo boreal a través de su ciclo de vida

Debido a la falta de información sobre la fracción fúngica del microbioma de los sapos, los autores de éste trabajo analizaron amplicones de la región ITS de sapos boreales (Anaxyrus boreas boreas) en su medio y diferentes estadios de desarrollo: huevo, renacuajo, metamorfos, subadultos y adultos. Además de buscar patrones en la diversidad de la…
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Búsqueda de ortólogos funcionales por medio de modelos ocultos de Markov

Las bases de datos de la Enciclopedia de Kyoto de Genes y Genomas (KEGG) son ampliamente usadas para analizar genomas y metagenomas bacterianos por su información detallada y la posibilidad de analizar rutas metabólicas visualmente. En el portal de internet de esta institución, existen servicios de anotación de secuencias como son el BlastKoala, GhostKoala y…
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Caracterización genómica de una bacteria vampiro que asecha en el agua salada

Las bacterias pertenencientes al grupo CPR (“Candidate Phyla Radiation”) suelen presentar genomas y células pequeñas, algunas de menos de 1 Mbp y 0.2 μm. Recientemente Moreira y colaboradores (2021), analizaron el genoma de una especie del grupo a la que nombraron Vampirococcus lugosii, en honor a Bela Lugosi, actor reconocido por su famosa interpretación de…
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Team bacteria

Dentro de sus hábitats los microorganismos no se presentan aislados, sino que interactúan con otras especies.  Las moléculas secretadas a menudo juegan un papel crucial en estas interacciones microbianas para garantizar la supervivencia. Dentro de este marco ecológico, muchos rasgos microbianos solo pueden establecerse mediante la cooperación de varios organismos. En este sentido, algunas moléculas…
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Variaciones en el microbioma rizosférico del algodón

La composición de las comunidades de microorganismos asociadas a raíces de plantas está influenciada por muchos factores, tales como las condiciones ambientales, las propiedades fisicoquímicas del suelo, las comunidades de microorganismos presentes en el suelo y el genotipo y estado de desarrollo de la planta hospedero. En este estudio, los autores analizan las comunidades rizosféricas…
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Sistemas de secreción tipo IV (TSS4) en las interacciones microbianas del suelo

Las bacterias del suelo interactúan con otros microorganismos de diversas formas, algunas de las cuales resultan benéficas para las plantas. Uno de éstos tipos de interacción es la depredación, la cual puede ser de tipo endobiótica (como sucede en el caso de Bdellovibrio) o epibiótica. Cuando es epibiótica, la célula depredadora establece contacto con la…
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Hongos que alimentan bacterias

Las plantas tienen la capacidad de liberar fotosintatos, a través de su raíz, hacia la hacia la rizosfera. Cuando las plantas se encuentran en una relación simbiótica con micorrizas una gran parte de los fotosintatos se asigna a los hongos que a cambio liberan nutrientes para la planta.  Por otro lado, las hifas micorrízicas producen…
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Herencia contra ambiente en la estructuración del microbioma del trigo

Este trabajo se realizó con la finalidad de entender la manera en que el microbioma de la semilla y el microbioma del suelo influyen en la estructuración del microbioma de las plantas. Para ello colectaron más de 200 suelos en un amplio rango espacial de sitios con y sin cultivos, a partir de los cuales…
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Importancia de los microorganismos promotores de crecimiento vegetal en la disminución de fertilizante

La aplicación de fertilizantes juega un papel muy importante en el aumento de la producción agrícola. El uso excesivo de fertilizantes puede disminuir la cantidad de materia orgánica en el suelo, acelera su acidificación y puede reducir el desempeño de los cultivos. En solución a esto, se ha propuesto la implementación de microorganismos benéficos y…
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Efectos de viajes internacionales sobre el microbioma intestinal y su resistencia antimicrobiana

Una de las consecuencias de los viajes internacionales es la colonización con microorganismos resistentes a antibióticos que pueden permanecer en el viajero durante períodos largos después del viaje, incrementando su transmisión a poblaciones susceptibles. Con el fin de elucidar qué microorganismos obtienen los viajeros y durante cuánto tiempo permanecen en la microbiota intestinal, Langelier y…
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Patrones en el microbioma del transporte urbano alrededor del mundo

Se estima que hoy en día, el 55% de la población mundial habita zonas urbanas, lo cual tiene repercusiones importantes en la estructura y transmisión del microbioma humano. Una de las características de mayor interés en los microbiomas de las grandes urbes es que existe una alta frecuencia de genes de resistencia a antibióticos (AMR,…
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Microorganismos biorremediadores de jales mineros

La minería aporta buena parte de los materiales necesarios para mantener nuestro estilo de vida: la producción de dispositivos electrónicos (como el que está usted usando para leer este texto), utensilios médicos y maquinaria dependen de ella. Uno de los métodos más empleados en la actualidad es la minería a cielo abierto, que consiste en…
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Las pseudomonas tienden a perder genes durante infecciones respiratorias crónicas

El contenido de genes de los genomas bacterianos se considera como un buen indicador de su potencial funcional a pesar de que este se encuentre regido por la maquinaria de regulación de la expresión. Esto es porque existe una tendencia a perder genes y se supone que si los genes se están manteniendo en el…
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Convergencia del microbioma de humanos y monos del viejo mundo demuestra la importancia de la ecología humana versus la filogenia.

El microbioma afecta de maneras muy diferentes pero dependen del desarrollo del huésped y el estilo de vida. Comparando diferentes clases de primates el humano tiene muchas diferencias ecológicas bien marcadas. Sin embargo es poco conocido que procesos fueron los que moldearon la composición del microbioma a escala evolutiva y las implicaciones de la adaptación…
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