El objetivo de este articulo fue obtenet el contenido de metales totales, o metaloma, de Pseudomonas aeruginosa PAO1 para observar las diferencias en el mismo en medios de crecimiento ricos en nutrientes (LB) y restringidos de nutrientes (medio de succinato y CCA). Esta cepa produce dos sideróforos (principalmente), piroverdina (PVD) y pioquelina (PCH). Debido a…
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En este trabajo se analizaron las comunidades microbianas a través del perfil (0-60 cm de profundidad) de jales mineros, haciendo una comparación entre el jal sin vegetación y dos plantas creciendo en el jal, Imperata cylindrica y Chrysopogon zizanioides. El objetivo era analizar el impacto que tiene la vegetación en las propiedades fisicoquímicas del jal…
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Este trabajo tuvo por objetivo estudiar la interacción mutualista entre dos levaduras en un sistema sintrófico donde cada cepa suplementaba un aminoácido esencial a la otra. Se realizaron monocultivos y co-cultivos de las cepas las cuales se marcaron con RFP (Leu-) y YFP (Trp-). Después de 24 horas de crecimiento se realizaba una dilución 1/10,…
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El objetivo de este trabajo fue caracterizar a la bacteria rizobia Rhizobium radiobacter cepa VBCK1062 la cual es resistente a arsénico, productora de EPSs y está asociada a la leguminosa Vigna radiata que crece en zonas agrícolas contaminadas con metales pesados, así como estudiar algunas de sus adaptaciones en éste ambiente. Caracterizaron el límite de resistencia…
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El objetivo de este trabajo fue estudiar la dinámica en la comunidades microbianas de la capa mucosa de la superficie del coral Porites astreoides a lo largo del ciclo natural de envejecimiento y muda de dicha capa mucosa, y de qué forma afecta al coral eliminar el microbioma natural de dicha capa mucosa a través…
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El uso de proteínas fluorescentes para marcar células no sólo prometía ser importante como marcador de selección, ha sudo de gran utilidad para visualizar y monitorear bacterias en su ambiente. Comunmente se han usado plásmidos con la proteína fluorescente expresada de forma constitutiva, sin embargo, el problema con esta metodología es que para preservar al…
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La técnica de hibridación fluorescente in situ o FISH ha sido ampliamente utilizada en microbiología ambiental y clúnica para identificar, aislar, identificar y aislar taxas microbianos. Sin embargo, la intensidad de la señal de fluorescencia es un factor limitante para la localizar a todos los miembros de la comunidad, debido a la autoflorescencia de la matriz…
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En este trabajo realizaron un screening de genes implicados en la esporulación de Bacillus subtilis mediante una aproximación de Tn-seq. Se construyó una biblioteca de inserciones de transposones, se secuenciarion en masse las regiones flanco de dichas inserciones y se analizó la diferencia en la frecuencia de lecturas en el tiempo cero (T0, el inicio…
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Tn-seq se basa en la construcción de una biblioteca saturada con inserciones de transpones. Después de la selección de biblioteca (sometiendo a los mutantes a una condición determinada) los cambios en la frecuencia de inserción de cada mutante se determinan al secuenciar en masse de las regiones flanco de las inserciones. Estos cambios en la…
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Las bacterias magnetotácticas que pertenecen a phyla basales han sido tratado de aislar sin éxito, se han analizado metagenomas de estas comunidades, sin embargo la información que brindan estos análisis se limitan a los miembros más abundantes de dichas comunidades. Mediante una aproximación de Single Cell Genomics fue posible obtener tres drafts de genomas de bacterias…
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En este trabajo propusieron cultivar paralelamente dos consorcios microbianos bajo las mismas condiciones que las comunidades naturales, para obtener el metagenoma de ambos y con las diferencias de abundancia de especies entre ambos consorcios reconstruir casi completamente las secuencias de los genomas de las especies. Esto lo proponen como un método para estudiar la…
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En este trabajo obtuvieron el microbioma de dos especies de cactus, Myrtillocactus geometrizans y Opuntia robusta. Realizaron un perfil filogenético de bacterias, arqueas y hongos de 6 compartimentos de la planta: el suelo distal y proximal a la raíz, la rizósfera y filósfera (epísfera), así como el interior de los tejidos de la raíz y…
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Este trabajo reporta bacterias endófitas aisladas de una planta hiperacumuladora de Cd que presentan actividades promotoras de crecimiento vegetal y son resistentes a metales pesados. Encontraron que 4 cepas aisladas son capaces de colonizar, realizaron ensayos para evaluar el crecimiento y la acumulación de metales en tejidos vegetal de plantas germinadas de semillas inoculadas con…
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En este trabajo realizaron un análisis espacial de la estructura de las comunidades de microorganismos de suelos contaminados metales pesados (Pb, Zn y Cd) al obtener el metatranscriptoma de zonas con contamiación baja, media y alta. Encontraron que los factores fisicoquímicos que determinaban la estructura de las comunidades microbianas fueron la concentración de metales, el…
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