También vamos a revisar este capítulo de BLAST: https://copy.com/xoSiDblPv9R4 Además de leerlo, y en lugar de control de lectura hacer (o intentar) los ejercicios del final del capítulo: 1. Which of the following in the BLAST output provides an estimate of the false positive rate of the BLAST search: E-value, Score, or Identity? 2. What…
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Vean estos dos videos, complementando la información con lo que vimos en clase, de igual forma detalla omisiones, el primer ejemplo es tradicional (con múltiples omisiones) Luego revisen el segundo video y lo que hacia la gente antes de poder hacer animaciones (1971), estudiantes de licenciatura, en la época hippie: Como dato curioso de este…
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http://web.ecologia.unam.mx/laboratorios/genomica/bioinfo/intro.bioinfo.cap1.pdf
Hola, este seminario estará a cargo de Oscar. La lectura recomendada, es la siguiente: The Core- and Pan-Genomes of Photosynthetic Prokaryotes https://drive.google.com/file/d/0B7dtIr9rg974YTVQTHk1VVBuNjNpTTJpU3pIMlMtSUdXd2g0/edit?usp=sharing
1. Field, D. et al. Open software for biologists: from famine to feast. Nat. Biotechnol. 24, 801–3 (2006). http://tinyurl.com/mwdh978
En base a lo que revisamos en clase y a lo que aparece en este capítulo http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK26887/ o en tu libro favorito de biología molecular por favor indica al menos 3 omisiones que hace el video. Además haz una lista con los pasos, enzimas, moléculas necesarias para pasar de una secuencia de DNA…
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Primero, hay que instalar bio-linux. Para determinar que opción te conviene más voy a considerar 4 escenarios: *Recomendada para el curso. Tienes Mac/Windows, con capacidad de usar Virtualbox (Procesador X64, virtualización, memoria suficiente (min 4 GB), disco duro (min 10 Gb)). Versión para Windows, para generar un disco de inicio, cargar una sesión en vivo.…
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De la página: http://elements.eaglegenomics.com/ Versión interactiva!
Vamos a revisar esta lectura: 1. Berendsen RL, Pieterse CMJ, Bakker P a HM: The rhizosphere microbiome and plant health. Trends Plant Sci 2012, 17:478–86. http://tinyurl.com/ljuugvp
Hacer una narración de que elementos se muestran en el vídeo, de acuerdo a lo que vimos en clase y lo que investigues por tu cuenta sobre el proceso de replicación. Resalta que elementos no se encuentran o se encuentran simplificados en el vídeo. Fecha límite de entrega: Miércoles 19 de febrero, 2014.
Para el seminario del grupo esta semana (14-Feb-2014) vamos a revisar este capítulo de BLAST: https://copy.com/xoSiDblPv9R4
1. Ellegren, H. Genome sequencing and population genomics in non-model organisms. Trends Ecol. Evol. 29, 51–63 (2014).
1. Alcaraz, L. D. et al. The genome of Bacillus coahuilensis reveals adaptations essential for survival in the relic of an ancient marine environment. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 105, 5803–8 (2008). Pueden descargarlo de aquí: http://tinyurl.com/memvcmh
#de cuenta Teoría Laboratorio PROMEDIO 412061323 7.045 7.14 7 307046712 8.884 7.24 8 307046925 8.214 6.89 8 308049716 7.559 7.78 8 305006020 NP NA NA 308023378 9.165 7.01 8 306534762 8.000 7.94 8 308001914 8.439 8.33 8 308037812 7.631 7.55 8 307174862 8.584 7.48 8 301089535 6.973 7.09 7 308173727 8.679 9.1 9 308280032 6.634…
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Hola, estoy esperando las calificaciones de laboratorio para poder tener el promedio final. En cuanto estén las calificaciones van a ser publicadas por este medio.
