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Las bacterias usan la secreción de proteínas para numerosas interacciones bióticas y abióticas, les permiten buscar nutrientes y establecer diferentes interacciones biológicas. El costo de sintetizar proteínas extracelulares es alto, generalmente requiere de energía y mecanismos complejos específicos de la membrana celular. Una vez fuera de la célula, estas proteínas se pierden para la bacteria…
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Los péptidos y policétidos no ribosomales son dos familias diversas de metabolitos secundarios con una amplia gama de actividades biológicas y de interés farmacológico. Por mencionar algunos, se incluyen toxinas, sideróforos, pigmentos, antibióticos, citostáticos e inmunosupresores. Los péptidos y policétidos no ribosomales se sintetizan en complejos enzimáticos grandes de péptido sintetasas no ribosomales (NRPS) y…
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La complicación ética del uso de diferentes organismos para ser usados como individuos de análisis en experimentos de infección por parásitos ha llevado a la necesidad de buscar nuevos modelos útiles que reflejen el efecto de la interacción del huésped con el parásito pero también con el microbioma asociado. En orden de buscar las 3R…
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La limitación de agua en los suelos ocasiona que la tasa de descomposición de la materia orgánica disminuye debido a que la actividad metabólica de los microorganismos se ve reprimida por el estrés hídrico. Diferentes trabajos han logrado identificar y aislar  a microorganismos resistentes al estrés hídrico, los cuales se han seleccionado y adaptado en…
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En éste trabajo se evaluó el efecto de ocho suelos distintos (colectados en África y Europa), ocho genotipos de trigo y dos tipos de manejo agrícola, para evaluar los factores más relevantes en la estructuración de la microbiota de raíz. Para ello se empleó la secuenciación masiva del gen 16S rRNA y de la región…
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La presencia de ambientes urbanos favorece la interacción con animales no nativos además de una reducción en la capacidad inmune de diferentes animales por la contaminación. Un aspecto fuerte en la intervención por parte de los asentamientos humanos es la disponibilidad de nuevos alimentos para la fauna silvestre, ya sea intencional como los comederos o…
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En este trabajo, se reportan los avances en la nueva versión de PhyloPhlAn, con la cual es posible comparar genomas estrechamente emparentados o bien miles de genomas de phyla distintos de forma eficiente. Esto se logra gracias a la incorporación de información como los 87,173 genomas de referencia y los 154,723 genomas ensamblados a partir…
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La relación planta-patógeno es un ejemplo más donde la concentración y la disponibilidad de los metales de transición son de gran importancia. De manera general, el fitopatógeno que invade una célula huésped puede alterar el proceso de metabolismo y adquisición de estos micronutrientes de la planta, haciéndola susceptible a la infección. En respuesta, el huésped…
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Las interacciones entre plantas y patógenos pueden ser moduladas mediante la inducción del sistema inmune innato de la plantas o vía la supresión de los patógenos por miembros de la comunidad microbiana del suelo. La supresión de los patógenos es una característica que ha sido observada en algunos suelos manejados bajo monocultivo y dicha característica…
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