Un tema frecuente en el estudio de la evolución de la cooperación mutualista en poblaciones naturales es la aparición de mutantes “egoístas”, que han perdido genes involucrados en la simbiosis, los cuales compiten con los simbiontes mutualistas por los recursos del hospedero. Las bacterias del género Mesorhizobium comúnmente forman asociaciones mutualistas con legumbres, y sus…
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Cuando se estudia genética y evolución nos enseñan sobre el poder de las mutaciones y como el balance de las mismas con otras fuerzas evolutivas tienen impactos en los individuos y las poblaciones. Cuando pensamos en mutaciones, casi siempre pensamos en el efecto queda y se debe a alteraciones en el DNA genómico y es…
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La influencia del genotipo de hospedero, el ambiente y del tipo de suelo se han reportado como fuentes de variación de las comunidades microbianas en las raíces de las plantas. En este artículo Schlaeppi y colaboradores se dedicaron a investigar la diversidad de la microbiota con un enfoque filogenético a través de tres especies del…
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Lotus japonicus es una especie capaz de establecer relaciones simbióticas con bacterias fijadoras de nitrógeno y formar nódulos. Para analizar el efecto de la pérdida de la capacidad para formar nódulos, en la estructuración de su microbiota de raíz (considentando muestras de suelo, rizósfera, endósfera y nódulos), se utilizaron amplicones del gen 16S rRNA para…
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La biotecnología y la biología sintética nos han permitido manipular microorganismos de manera que podamos aprovechar sus capacidades. Uno de los problemas que presentamos es que hay necesidad de «domesticar» a las bacterias para poder realizar ingeniería genética y tenemos la limitante de la transferencia del DNA hacia un nuevo huésped bajo condiciones óptimas de…
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El cambio climático es una amenaza para las poblaciones de plantas y animales. Aunque algunas especies pueden reaccionar rápidamente por medio de la plasticidad fenotípica o la migración, no se sabe si estas modificaciones pueden seguirle el paso a los cambios ambientales que se observan en la actualidad. Por otro lado, se ha reportado que…
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En este articulo los autores se preguntaron cómo la microbiota de raíz está estructurada a lo largo del ciclo de vida del arroz y si los cambios temporales son consistentes entre diferentes ubicaciones geográficas. Para resolver esto tomaron 1550 muestras de rizosfera, rizoplano y endosfera procedentes de plantas de arroz en dos localidades distintas (California…
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El desarrollo de la secuenciación de DNA de alto rendimiento ha permitido recuperar genomas a partir de secuencias de muestras ambientales. Un paso clave en este proceso es clasificar las secuencias en unidades discretas, llamadas cajones (bin en inglés), para ello se utiliza la información de composición de tetranucleótidos y la cobertura de las secuencias…
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El famoso calamar Euprymna scolopes forma una relación simbiótica con Vibrio fischeri, responsable de la bioluminiscencia del animal. Diferentes cepas de esta bacteria han sido aisladas de las criptas en el órgano luminoso del cefalópodo, las cuales son colonizadas inmediatamente después de la eclosión de los huevos por poros que permiten la entrada de una…
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La variación de la disponibilidad de hierro en el ambiente provoca que las células bacterianas tengan que implementar un control complejo sobre los mecanismos involucrados en la homeostasis del hierro. En bacterias, el regulador de consumo del hierro Fur es el principal factor de transcripción que controla la homeostasis del hierro; sin embargo, los detalles…
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El orden Rhizobiales constituye una parte importante del microbiomas núcleo de la raíz de varias especies de plantas, el cual cuenta con especies fijadoras de nitrógeno y promotoras del crecimiento vegetal. Para el estudio del taxa, los autores del trabajo sembraron plantas de Arabidopsis thaliana en suelo, de las cuales obtuvieron la porción de rizósfera,…
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Ya hace más de 10 años se hizo un primer intento de hacer una filogenia de bacterias utilizando información de genomas completos, esto con el bemol de que al usar la información de los genomas completos siempre se termina comparando los genes ortólogos compartidos absolutamente por todos los organismos a comparar. Esta publicación fue la…
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La transformación natural en bacterias, es un mecanismo de transferencia horizontal de genes. Se ha sugerido que el pili es una estructura que, entre otras funciones, une DNA extracelular y lo transloca activamente a través de la membrana. Por otro lado, un modelo alternativo propone que el pili actúa como “guardian” para abrir un poro…
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El género Caulobacter ha sido históricamente aislado de ambientes acuáticos y por ende descrito como un microorganismo con un estilo de vida oligotrófico. En este trabajo, Willhelm realiza un meta análisis de estudios donde se caracterizan microbiomas por medio de bibliotecas de amplicones del gen rRNA 16S y también metagenomas completos. El objetivo del estudio…
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Se sabe que el efecto de los metales sobre la homeostasis celular depende mucho de la dosis a la que las células han sido expuestas y de los mecanismos que regulan su interacción, los cuales pueden variar de un organismo a otro. Como caso particular, la exposición a compuestos metálicos altera la diversidad y…
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